شناسايي و توالي‌يابي باكتري‌هاي ايجادكننده بيماري‌هاي پريودنتال و ارتباط آن با پلي‌مورفيسم ژنومي اينترلوكين-6 با روش Tetra-Arms-PCR

Identification and sequencing of periodontal-causing bacteria and its Relationship with Interleukin-6 Gene Polymorphism by Tetra-Arms-PCR

سابقه و هدف: عفونت‌هاي پريودنتال همواره جزو شايع‌ترين بيماري‌هاي دهان و دندان است و مهم‌ترين علت از دست رفتن دندان‌ها پس از پوسيدگي محسوب مي‌گردند. هدف از انجام مطالعه حاضر شناسايي و توالي­يابي باكتري‌هاي ايجادكننده بيماري پريودنتال و ارتباط آن با پلي­مورفيسم ژنومي اينترلوكين-6 با روش Tertra-Arms-PCR بود. مواد و روش ها: در اين مطالعه مورد-شاهدي، تعداد 100 نمونه پلاك فوق لثه­اي (50 فرد مبتلا به عفونت پريودنتال و 50 فرد سال) زير نظر پريودنتيست جمع‌آوري گرديد. پس از استخراج DNA ژنومي ، شناسايي سويه‌هاي باكتريايي با استفاده از تكثير ژن S rRNA16 انجام گرديد. همچنين پس از استخراج DNA سلولي از نمونه‌هاي خون اخذشده، پلي­مورفيسم ژنوم كد كننده IL-6 با استفاده از روش Tertra-Arms-PCR انجام گرديد. ترادف­يابي با استفاده از روش سانگر انجام گرديد و درنهايت به منظور تعيين قرابت ژنتيكي سويه‌ها درخت فيلوژني با استفاده نرم‌افزار MEGA 7 ترسيم گرديد. يافته ها: در پژوهش حاضر در مجموع باكتري‌هايي از جنس استافيلوكوكوس، لاكتوباسيلوس، استرپتوكوكوس، آكروموباكتر، گرانوليكاتلا آدياسنس، گوردونيا و كوكوريا ريزوفيلا در بيماران پريودنتال يافت شد. همچنين در مقايسه با گروه كنترل، رابطه معني‌داري بين ژنوتيپ G/G در -174G/C در بيماران پريودنتال مشاهده شد. (0/05>P) نتيجه گيري: وجود ارتباط پلي مورفيسم ژن 174 اينترلوكين 6 و پريودنتيت مزمن در جامعه مورد بررسي، وجود اين ژن را به عنوان يك عامل خطر در ابتلا به بيماري پريودنتيت مزمن مطرح مي كند و مي تواند به عنوان يك نشانگر در تعيين استعداد ابتلا به بيماري فوق مطرح باشد.

Background & Aim: Periodontal infections are among the most common oral and tooth diseases and recognized as the main cause of the tooth loss after decay. The purpose of this study was to identify and sequencing of the periodontal-causing bacteria and its relation with interleukin-6 gene polymorphism by Tetra-Arms-PCR method. Material and methods: In this case-control study, 100 samples (50 periodontal infections and 50 healthy people) were collected under the supervision of a dentist. After genomic DNA extraction using the sinaclon Company Kit, identification of bacterial strains was performed using 16S rRNA gene amplification. Also, after extraction of cellular DNA from blood samples taken, the polymorphism of the genome encoding IL-6 was performed using the Tetra-Arms-PCR method. The sequencing was carried out by the Sanger method and by Bioneer Company, and finally, the MEGA 7 software was scanned to determine the genetic affinity of the phylogeny tree strains. Results: In the present study, bacteria of Staphylococcus, Lactobacillus, Streptococcus, Acroombocator, Granulicatla Adiasens, Gordonia and Kocuria rhizophila were found in periodontal patients. Also, there was a significant relationship between G/G genotype in -174G/C in periodontal patients compared to control group.(p<0.05) Conclusions: The correlation between Polymorphism -174G / C in IL-6 and chronic periodontal disease, suggested that, presence of this gene, might be a risk factor for chronic periodontal disease involvement and also, can be an indicator for susceptibility of the mentioned disease involvement.