بررسي فراواني آللي و پارامترهاي ژنتيك قانوني 10 جايگاه str در اقوام كرد و عرب ايراني

Investigation of allelic frequency and forensic genetics parameter for 10 STR loci in Arab and Kurd ethnics of Iran

توالي هاي كوتاه تكراري(short tandem repeat; str)، بخش هاي حفاظت شده در ژنوم انسان هستند كه در بين افراد مختلف، پلي مورفيسم بالايي را نشان مي دهند. امروزه نشانگرهاي مبتني بر اين جايگاه ها به عنوان ابزار اصلي تعيين هويّت در دنيا مطرح مي باشند. با توجه به متفاوت بودن فراواني آللي اين جايگاه ها در جمعيت هاي مختلف، به منظور استفاده از آنها بايد نسبت به بررسي پارامترهاي ژنتيكي آنها در هر جمعيت اقدام نمود. هدف از اين مطالعه، بهينه سازي روش آزمايشگاهي براي استفاده از 10جايگاه str اتوزومي (tpox، vwa، d7s820، d8s1179، d13s317، d16s539، d18s51، d5s818، tho1، d21s311) و همچنين بررسي پارامترهاي ژنتيكي اين جايگاه ها و كارآيي آنها در زمينه تشخيص هويّت در اقوام كرد و عرب ايران بود. روش تحقيق: در اين مطالعه نيمه تجربي، نمونه هاي تصادفي خون از 93 فرد عرب و 94 فرد كرد تهيه و پس از استخراج dna، ده جايگاه اتوزومي با استفاده از واكنش pcr تكثير شدند. سپس به منظور تعيين ژنوتيپ هر فرد در هر جايگاه از الكتروفورز ژل آكريل آميد استفاده شد.يافته ها: جايگاه d13s317 در هر دو جمعيت حتي پس از اعمال تصحيح bonferroni از تعادل هارديواينبرگ انحراف داشت. پس از اين جايگاه، بيشترين هتروزيگوسيته مشاهده شده در جمعيت كرد 94درصد مربوط به جايگاه d21s311 و 84درصد در جمعيت عرب براي جايگاه هاي tho1، vwa و d5s818 بود. كمترين هتروزيگوسيته مشاهده شده به ترتيب 71درصد و 72درصد مربوط به جايگاه tpox در جمعيت هاي كرد و عرب بود. بررسي شاخص هاي ژنتيك پزشكي قانوني (pi, pe, pd pic) نشان دادند كه به جز جايگاه d13s317 باقي 9 جايگاه ژني ارزيابي شده، داراي مشخصات خوبي براي استفاده در انگشت نگاري ژنتيكي در جمعيت هاي كرد و عرب بودند. نتيجه گيري: نتايج اين پژوهش ضرورت بررسي خصوصيات ژنتيكي قانوني قوم هاي مختلف ساكن نقاط مختلف جغرافيايي ايران به منظور انتخاب مجموعه داده مناسب براي محاسبه پارامترهاي ژنتيك قانوني، نه تنها در داخل هر قوم بلكه بين آنها را نشان مي دهد.

Short tandem repeat (STR) markers, are conserved region in human genome and highly polymorphic between individuals. Nowadays, genotyping of STR marker is widely known and used for the genetic identification of individuals in forensic DNA analyses. Based on allelic frequencies of STR loci varies between populations, investigation of genetically and forensically parameters in each population and characterization of these markers is necessary. The objective of this study was to optimizing laboratory method for application of 10autosomal STR loci (TPOX ،vWA ،D7S820 ،D8S1179 ،D13S317 ،D16S539 ، D18S51 ،D5S818 ،THO1 ،D21S311) in Kurd and Arab ethnics of Iran and investigation of population and forensic genetics parameter of these markers in these populations. Materials and Methods: In this semi-experimental study, blood samples from 93 Arab and 94 Kurd individuals were collected. After DNA extraction, PCR amplification was carried out for 10 autosomal STR loci, individually. Then, acrylamide gel electrophoresis was used to determine the genotype of each individual in each site. Results: Deviation from Hardy Weinberg equilibrium even after Bonfferroni correction was seen in the locus of D13S317in both Populations. After D13S317 loci, the highest observed heterozygosity was seen in D21S311loci for Kurd population (94%) and in THO1, vWA and D5S818 locifor Arab population (84%). The lowest observed heterozygosity (0.71 and 0.72) was seen in TPOX loci for both populations form Arab and Kurd ethnics, respectively. Investigation of forensic genetic parameters (PI, PE, PD, and PIC) showed that in except of the D13S317 loci other remaining evaluated locus had proper properties for using in genetics fingertips in both of Kourd and Arab ethnics. Conclusion: The results of current study indicate that the necessity investigation of forensic genetics for rapid characterization of the different ethnicities which located in different geographic parts of Iran in order to choose the appropriate data set to calculate of forensic genetics parameters not only within each ethnic but also between them.