پلاسميد رپليكون تايپينگ سروتيپ هاي o2 ، o6 و o157 باكتري اشريشيا كلاي با استفاده از روش pcr مبتني بر تكثير گروه هاي ناسازگار (pbrt)

Replicon Typing of O2, O6, and O157 Serotypes of Escherichia Coli Using PCR Method Based on Plasmid Incompatibility Groups

امروزه از روش pcr مبتني بر تكثير گروه هاي ناسازگار عمده پلاسميدي در مطالعات اپيدميولوژيكي براي توصيف انتشار صفاتي چون مقاومت آنتي بيوتيكي در باكتري هاي خانواده انتروباكترياسه استفاده مي شود. علي رغم نقش حياتي پلاسميد ها در انتقال عوامل بيماري زا، مطالعات چنداني روي نوع پلاسميدهاي حمل شده توسط سروتيپ هاي باكتري اشريشيا كلاي انجام نگرفته است. هدف اصلي اين مطالعه دسته بندي پلاسميد هاي سروتيپ هاي o2 o6 و o157 باكتري اشريشياكلاي بر اساس گروه هاي ناسازگار عمده پلاسميدي به روش multiplex-pcr مي باشد.مواد و روش ها: اين مطالعه توصيفي بر روي 40 ايزوله اشريشياكلاي متعلق به سروتيپ هاي o6، o2 و o157 به منظور شناسايي 8 رپليكون پلاسميدي(incn، incfib ،frep ، incb/o،inc fiia ، incfic،incfia، inci1) به روش multiplex - pcr انجام گرفت.يافته ها: نتاج نشان داد كه امپليكون fre با 88% و رپليكون هاي incfib(78%) , incfia(60%), incb/o(53%), inci1(50%), incn(25%) در بين 40 ايزوله مورد مطالعه مشاهده شد. رپليكون incfic و incfiia در هيچكدام از ايزوله ها مشاهده نشد.نتيجه گيري: نتايج اين مطالعه بيانگر تنوع بالاي گروه هاي ناسازگار پلاسميدي در بين ايزوله هاي مورد مطالعه بود.

Today, the PCR-based replicon typing of major plasmid incompatibility groups is used in epidemiological studies to describe the distribution of traits such as antibiotic resistance in the bacteria of enterobacteriaceae family. Despite the crucial role of plasmids in transmitting pathogens, little studies have been conducted on the type of plasmid transmitted by bacterial serotypes of E. coli. The main objective of this study was to classify plasmid O2, O6 and O157 serotypes of E. coli bacteria based on major plasmid incompatibility groups using multiplex-PCR method. METHODS: This descriptive study was performed on 40 isolates of E. coli related to O6, O2 and O157 serotypes to identify 8 plasmid replicons (IncN, IncFIB, FreP, IncB/O, Inc FIIA, IncFIC, IncFIA, IncI1) by multiplex-PCR method. RESULTS: The results showed that the amplicon of Fre (88%), and replicons of IncFIB (78%), IncFIA (60%), IncB/O (53%), IncI1 (50%), IncN (25%) were observed in 40 studied isolates. IncFIC and IncFIIA replicons were not observed in any of the isolates. CONCLUSION: The results of this study indicated a high diversity of plasmid incompatibility groups among the studied isolates.