رديابي و شناسايي مولكولي گونه ‏هاي Colletotrichum عامل بيماري آنتراكنوز برخي گياهان در استان خوزستان

تحقيق حاضر به منظور شناسايي گونه‏ هاي Colletotrichum همراه علايم آنتراكنوز در برخي گياهان در استان خوزستان، با استفاده از روش‏هاي مبتني بر ريخت‌شناسي و تجزيه و تحليل مولكولي انجام شد. طي سال‏هاي 96-1395، 40 نمونه برگ و ميوه داراي علايم آنتراكنوز از گياهان توت‏فرنگي، پرتقال، ليمو‏ترش، موز، يونجه و نارنج جمع‏آوري شد كه براساس بررسي‌هاي ريخت‏شناسي، 12 جدايه آن‏ها، از جنس Colletotrichum بودند. از اين جدايه‏ها، زيست‏توده ميسيليومي در محيط PDB تهيه و خشك‏انجمادي انجام شد. استخراج DNA با استفاده از يك روش آلي مبتني بر فنل و كلروفرم انجام شد و سپس، ناحيه ITS و بخش‏هايي از نواحي 28S-D1/D2 وTub2با استفاده از آغازگرهاي عمومي و اختصاصي تكثير و توالي‌يابي شدند. توالي‏هاي حاصله با توالي‏هاي مربوط به استرين‏هاي تيپ در بانك ژن با استفاده از الگوريتم BLASTn و تجزيه و تحليل فيلوژنتيكي (الگوريتم درست‏نمايي بيشينه) مورد مقايسه قرار گرفتند. گونه‏هايColletotrichum gloeosporioides،C. karstii، C. musae، C. nymphaeae و C. truncatum شناسايي و ريخت‏شناسي آن‏ها بررسي شد. در درخت فيلوژنتيكي مبتني بر توالي‏هاي تركيبي، دو ناحيه ژني ITS و Tub2، جدايه‏هاي Colletotrichum تحت مطالعه با استرين‏هاي معتبر از هر گونه خوشه‏بندي شدند و كلاد‏هايي معتبر با ارزش بوت‏استراپ 99-96 درصد ايجاد كردند.