ارزيابي بيان ژن (lncRNA ANRIL(CDKN2B-AS1 در مبتلايان بيماري‌هاي التهابي روده

Evaluation of lncRNA ANRIL (CDKN2B-AS1) gene expression in patients with inflammatory bowel disease

مقدمه بيماري‌هاي التهابي روده سبب التهاب مزمن و عودكننده‌ي دستگاه گوارش مي‌شوند و به دو بيماري كرون و كوليت اولسراتيو تقسيم‌بندي مي‌گردند. در اين مطالعه به‌منظور دست‌يابي به بيوماركري براي تشخيص و پيش‌آگهي بيماري‌هاي التهابي روده، بيان ژن lncRNA ANRIL (CDKN2B-AS1) مورد بررسي قرار گرفت. مواد و روش‌‌ها اين مطالعه شامل 33 بيمار مبتلا به بيماري‌هاي التهابي روده و 20 فرد سالم است كه به پژوهشكده كبد و گوارش دانشگاه شهيد بهشتي مراجعه كرده بودند. RNA از نمونه‌هاي بافتي استخراج‌شده و cDNA آن‌ها ساخته شد. تكثير ژن‌ها با هدف اندازه‌گيري بيان ژن توسط واكنش Real time PCR كمي صورت گرفت و داده‌هاي خام با استفاده از نرم‌افزار Rest تجزيه‌وتحليل شدند. داده‌هاي حاصل از مقايسه بافت‌هاي بيمار و سالم از طريق آناليز Student’s t-test و One-way ANOVA مورد ارزيابي قرار گرفتند. يافته‌‌ها در اين مطالعه‌ هردو بيماري كرون و كوليت بر اساس تمامي مشخصات بيماري كه التهاب را نيز شامل مي‌شد موردبررسي قرار گرفتند و اختلاف معناداري در ميان بيماران كرون و كوليت در مقايسه با افراد كنترل مشاهده نگرديد (1340/0=P). در بررسي ميزان بيان lncRNA ANRIL در دو جنس زن و مرد نيز اختلاف معني‌‌داري مشاهده نگرديد (2571/0=P). نتيجه‌‌گيري نتايج حاصل از آناليز داده‌ها نشان مي‌دهد كه نمي‌توان از lncRNA ANRIL به ‌عنوان بيوماركري جهت تشخيص و تميز بيماري‌هاي التهابي روده در جامعه ايراني استفاده كرد.

Introduction and Aims: Inflammatory bowel disease causes chronic and relapsing gastrointestinal inflammation that classified into Crohn's disease and ulcerative colitis. In this study, in order to obtain biomarker for diagnosis and prognosis of inflammatory bowel disease, lncRNA ANRIL (CDKN2B-AS1) gene expression was evaluated. Materials and Methods: This study included 33 IBD patients and 20 healthy individuals who referred to the Research Institute for Gastroenterology & Liver Diseases ShahidBeheshti University.RNA extracted from tissue samples and subsequently, their cDNA was synthesized. Gene amplification was performed with the aim of measuring the gene expression by a real-time quantitative PCR (qRT-PCR) reaction. Data from comparing healthy and healthy tissues were assessed by Student's t-test and One-way ANOVA. Results: In this study, both Crohn's disease and ulcerative colitis were evaluated based on Features of the disease that included inflammation, and no significant difference was found between Crohn's disease and ulcerative colitis patients compared to healthy individuals (P value=0.1340). Also, there was no significant difference in the expression of lncRNA ANRIL in both males and females (P value = 0.2571). Conclusions: The results of the data analysis show that lncRNA ANRIL cannot be used as a biomarker for the diagnosis and differentiation of inflammatory bowel disease in Iranian society.