عنوان مقاله :
برآورد ميزان توليد پروتئين A نوتركيب خارج سلولي از باكتري Escherichia coli BL21 با استفاده از روش رگرسيون كمترين مربعات فازي هيبريدي
عنوان به زبان ديگر :
Fuzzy Hybrid least-Squares Regression Approach to Estimating the amount of Extra Cellular Recombinant Protein A from Escherichia coli BL21
پديد آورندگان :
آرمند، رحام دانشگاه صنعتي خاتم الانبياء(ص) بهبهان - گروه زيست شناسي , ريگي، گرشاسب دانشگاه شهركرد - گروه ژنتيك , بهرامي، طاهره دانشگاه صنعتي خاتم الانبياء(ص) بهبهان - گروه زيست شناسي
كليدواژه :
بيوتكنولوژي پزشكي , رگرسيون فازي هيبريدي , پروتئين متصل شونده به ايمونوگلوبين , پروتئين A
چكيده فارسي :
مقدمه: ايميون پروتئين A يك مولفه با طيف وسيعي از كاربردهاي بيوشميايي، بيوتكنولوژي و پزشكي است. ژن كدكننده اين پروتئين از باكتري استافيلوكوكوس اورئوس استخراج و در باكتري اشريشياكلي كلون و بيان شد. جهت بهينه سازي شرايط بيان به منظور سنجش دقت آزمايش و تضمين صحت كار در آزمايشات بعد، كاهش هزينه و جلوگيري از روش هاي آزمون و خطا و دستيابي به بيشترين ميزان توليد، از روش هاي آماري مناسب استفاده مي شود.
مواد و روش ها: روش رگرسيون آماري معمولي بر پايه فرض دقيق بودن متغيرهاي مورد مطالعه و مشاهدات مربوط به آن ها استوار بوده و در نهايت روابط بين متغيرها نيز به طور دقيق مشخص مي شود. در مدل سازي طبيعي مانند برآورد ميزان پروتئين، عموماً ممكن است با مشاهدات نادقيق و با روابط مبهم روبرو شويم، بنا بر اين استفاده از روش هاي رگرسيون كه قادر به تبيين ساختار مبهم ميزان پروتئين و در اختيار نهادن الگوهايي كه منطبق با واقعيت هستند، ضروري مي باشد. در اين مقاله از روش رگرسيون فازي هيبريدي با كمترين مربعات كه مبتني بر نظريه مجموعه هاي فازي مي باشد استفاده شد.
يافته هاي پژوهش: مقدار برآورد شده پروتئين A با اطمينان 90 درصد صحيح محاسبه شده و از طرفي با توجه به اين كه روش مورد استفاده در اين مقاله روش رگرسيون فازي هيبريدي با كمترين مربعات خطا(برآورد با كمترين مربعات خطا) مي باشد لذا اگر تمامي داده هاي مورد استفاده در اين مقاله اعداد ترد(غير فازي) باشند نتايج حاصل از رگرسيون فازي هيبريدي مشابه رگرسيون معمولي است.
بحث و نتيجه گيري: يكي از مزاياي رگرسيون فازي هيبريدي اين است كه نسبت به برآورد نقطه اي داراي سطح اطمينان بالاتري مي باشد. در اين مطالعه انحراف معيار داده هاي برآورد شده به روش رگرسيون فازي هيبريدي كمتر از روش رگرسيون معمولي بود كه مي توان نتيجه گرفت كه روش رگرسيون فازي هيبريدي روش بهينه اي جهت برآورد ميزان توليد اين نوع پروتئين است
چكيده لاتين :
Introduction: Immune Protein A is a component with a vast spectrum of biochemical, biological and medical usages. The coding gene of this protein was extracted from Staphylococcus aureus and was cloned and expressed in Escherichia coli bacteria. Suitable statistical methods are utilized to optimize expression conditions for evaluating experiment accuracy , guarantee the accuracy of subsequent experiments, reduce cost , prevent trial and error method, and obtain the highest production level.
Materials & Methods: Normal statistical regression method is based on the assumption of accuracy of variables and their observations, and finally the relationship among the variables are precisely specified .In normal modeling ,such as estimation of protein level inaccurate observations and vague relationships may be encountered; therefore,utilization of regression methods capable of explaining the vague structure of protein level and providing the models attunes to reality is necessary. In this article, hybrid fuzzy regression method with the least square, based on fuzzy-set theory was utilized.
Findings: According to the results, Protein A production level was estimated at 90 % level .On the other hand, since the method utilized in this article was hybrid fuzzy linear regression method with the least square errors, we can conclude that if all the data utilized in this article are crisp numbers,the hybrid fuzzy regression will produce results similar to normal regression.
Discussion & Conclusions: One of the advantages of hybrid fuzzy regression is higher level of certainty than point estimation. In this study, the standard deviation of estimated data by fuzzy hybrid regression method was lower than conventional regression method.Therefore, it can be concluded that fuzzy hybrid regression method is an optimal method for estimating the production of this type of protein.
عنوان نشريه :
مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي ايلام