مطالعه بيوانفورماتيكي ساختار ساقه‌حلقه و كلون نمودن سازه لازم جهت بيش‌ بيان آن

زمينه: ERBB2 عضوي از خانواده گيرنده هاي فاكتور رشد اپيدرمي بوده و بر روي بازوي بلند كروموزوم 17 قرار گرفته است. اين گيرنده مي تواند باعث فعال شدن مسيرهاي پيام رساني شده و در نهايت تكثير سلولي را افزايش و از آپوپتوز جلوگيري كند. miRNAها RNAهاي غيركدكننده تك رشته اي كوچكي هستند كه به عنوان تنظيم كننده هاي بيان ژن در سطح پس از رونويسي عمل مي كنند. miRNA ها فرآيند هاي مهم سلولي مانند تكثير، تمايز، آپوپتوز و تومورزايي را كنترل مي كنند. ناحيه ژنومي miRNA ها نشان مي دهد كه آن ها در نواحي كروموزومي حساس و مرتبط با سرطان قرار گرفته اند. هدف از اين تحقيق انجام مطالعات اوليه بيوانفورماتيكي جهت شناسايي miRNA جديد در ژن مهم ERBB2 و ساختن سازه لازم جهت بيش بيان ناحيه مورد نظر است. روش‌ كار: در تحقيق حاضر ابتدا با نرم افزارهاي مختلف توانايي ايجاد ساختار ساقه حلقه، محل برش آنزيم هاي Dicer و Drosha و حفاظت شدگي ناحيه مورد نظر بررسي گرديد. سپس ناحيه اطراف ساختار ساقه حلقه كانديد در حامل بياني pEGFPC1 كلون گرديد. يافته‌ها: بررسي با نرم افزار هاي مختلف نشان داد كه از اين توالي و ساختار miRNA بالغ، با احتمال بالا مي تواند پردازش گردد. جهت ادامه مطالعات سازه مورد نياز در حامل بياني pEGFPC1 با موفقيت كلون گرديد. نتيجه‌ گيري: نتايج مبني بر تجزيه و تحليل هاي بيوانفورماتيكي نشان دهنده امكان توليد miRNA جديد از اين ساختار ساقه حلقه مي باشد.