بررسي همراهي پلي مورفيسم هاي rs46522 در ژن UBE2Z و rs7903146 در ژن TCF7L2 با ديابت نوع دو در جمعيت عرب استان خوزستان: مطالعه ي مورد-شاهدي

Association study of the rs46522 polymorphism in UBE2Z and rs7903146 polymorphism in TCF7L2 gene with T2DM in Arab population of Khuzestan province: case-control study

زمينه بروز ديابت نوع 2 تحت تاثير تعامل عوامل وراثتي با عوامل محيطي است. تاكنون حدود 60 لوكوس ژنتيكي مرتبط با اين بيماري شناسايي شده است كه در اين ميان ژن TCF7L2 از بيشترين اهميت برخوردار است. يكي از لوكوس‌هاي تحت تاثير ژن TCF7L2 كه همراهي آن نيز با ديابت نوع 2 اخيرا مشخص شده است، لوكوس دربردارنده‌ي ژن (Ubiquitin Conjugating Enzyme E2Z), UBE2Zمي‌باشد. در اين مطالعه به بررسي همراهي پلي‌مورفيسم‌هاي rs7903146 در ژن TCF7L2 و rs46522 در ژن UBE2Z با ديابت نوع 2 در جمعيتي از اقوام عرب استان خوزستان پرداخته شد. روش‌كار تعداد 100 نمونه‌ي بيمار و 97 نمونه‌ي كنترل از جمعيت عرب ساكن استان خوزستان جمع‌آوري شد. تعيين ژنوتيپ اين افراد با روش PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction- Restriction Fragment Length Polymorphism) صورت گرفته و با توالي‌يابي مستقيم تاييد شد. آناليزهاي آماري بوسيله نرم‌افزار SPSS (نسخه16.0) انجام شد. تست χ2 و رگرسيون لاجستيك براي مقايسه نسبت‌هاي ژنوتيپي و آللي استفاده شد. نتيجه گيري در بررسي rs7903146 با مبنا قرار دادن ژنوتيپ TT، مقدار or براي ژنوتيپ‌هاي CC و CT به ترتيب برابر با 75/1 (28/0=p، 88/4 – 63/0، CI 95%) و 94/0 (84/0=p، 79/1 – 49/0، CI 95%) بدست آمد. براي rs46522 با مبنا قرار دادن ژنوتيپ CC، مقدار or براي ژنوتيپ‌هاي TT و TC به ترتيب برابر با 41/1 (45/0=p، 42/3 - 58/0، CI 95%) و 22/1 (54/0=p، 35/2- 64/0، CI 95%) محاسبه شد. در مطالعه‌ي هر دو واريانت تفاوت معناداري بين فراواني ژنوتيپي و اللي گروه كنترل و بيمار مشاهده نشد. اين مطالعه همراهي واريانت‌هاي rs46522 و rs790314 با ديابت نوع 2 در جمعيت مورد مطالعه را تاييد نكرد.

Background The prevalence of Type 2 diabetes (T2DM) has been increasing rapidly. Transcription factor 7like 2 (TCF7L2) has been found to has a strong role in the pathogenesis of T2DM. This gene codes an important transcription factors in the Wnt signaling pathway which secrets in pancreatic β-cells and other tissues. Significant associations have been showed between rs7903146 and T2D risk in nearly all populations. Also many loci such as UBE2Z rs46522 that is affecting by TCF7L2 transcription factor have been found associated with T2D. Our objective was to explore whether mentioned SNPs are associated with the risk of T2D among our Arab population of Khuzestan. Methods We performed a case-control study using 100 T2D patients (WHO criteria), and 97 controls (age > 30; with FBS ≥126 mg/dl) of Arab people of Khuzestan province. Genotyping was performed by PCR-RFLP and was confirmed by direct sequencing. Statistical analyses were performed using SPSS version 16.0. Results No significant difference in genotype frequencies was observed between the T2DM patients and normoglycemic controls. The rs7903146 (C/T) polymorphism odds ratios for CC and TC genotypes were 1.75 (95% CI, 0.63 to - 4.88; p= 0.28) and 0.94 (95% CI, 0.49 to - 1.79; p= 0.84) compared with the TT genotype, respectively. The rs46522 (C/T) polymorphism odds ratios for TT and TC genotypes were 1.41 (95% CI, 0.58 to - 3.42; p= 0.45) and 1.22 (95% CI, 0.64 to - 2.35; p= 0.54) compared with the CC genotype, respectively. Conclusion Our study indicates no association of T2D in Arab population of Khuzestan province with the rs7903146 and rs46522 and rs46522 variants