ژنوتايپينگ ويروس برونشتي عفوني پرندگان در گله هاي گوشتي استان اردبيل در سال 2016

ويروس برونشيت عفوني (IBV) عامل بيماري ويروسي حاد تنفسي در طيور همراه با رال‌هاي تنفسي و سرفه و عطسه مي‌باشد. كرونا ويروس‌ها طيف گسترده‌اي از بيماري‌هاي تنفسي، روده‌اي، كبدي، عصبي با حدت‌هاي مختلف در گربه‌ها، سگ‌ها، خوك‌ها، جوندگان، گاو، پرندگان و انسان ايجاد مي‌كنند. ويروس برونشيت عفوني عامل بسيار واگيردار بيماري برونشيت عفوني در طيور مي‌باشد. كرونا ويروس‌ها توانايي نوتركيبي و جهش زيادي دارند. توالي‌يابي ژنS1  براي مطالعات اپيدميولوژي مولكولي و مشخصات ژنوتيپي ويروس برونشيت عفوني كاربرد دارد. به منظور فراهم شدن درك بهتري از اپيدميولوژي مولكولي ويروس برونشيت عفوني در ايران جدايه‌هاي ژن S1 ويروس برونشيت عفوني طيور كه در مزارع گوشتي در استان اردبيل جمع‌آوري شده بود، در اين مطالعه توالي يابي شد. در سال 1395 در محدوده استان اردبيل 30 عدد سواب ناي از گله‌هاي گوشتي به صورت تصادفي براي رديابي و تعيين ژنوتيپ ويروس جمع‌آوري گرديد. سپس RNA آنها با استفاده از كيت تخليص RNA استخراج گرديد. ساخت cDNA با روش RT-PCR صورت گرفت و محصول RT-PCR با روش Nested- PCR با پرايمرهاي كد كننده5’UTR، تكثير شد. اين كار جهت شناسايي ويروس برونشيت عفوني صورت گرفت.براي تعيين ژنوتيپ نمونه‌هاي مثبت (توالي يابي ژن گليكوپروتئين S) با ارسال به شركت كره‌اي انجام شد. 70 درصد نمونه‌هاي نايي مثبت بودند كه در ادامه شناسايي سروتيپ‌ها بر اساس پروتكل‌هاي موجود انجام شد. در اين مطالعه مراحل استخراج و RT-PCR بر روي نمونه‌هاي مشكوك مثبت چندين بار تكرار شد. مي‌توان نتيجه گرفت كه كرونا ويروس در بين گله‌هاي گوشتي كشور در حال چرخش است. در طول مراحل آزمايش از دو كنترل منفي شامل كنترل منفي استخراج و كنترل منفي واكنش RT-PCR استفاده گرديد. آناليز ژنتيكي بر اساس توالي نوكلئوتيدي بخش بسيار تغيير پذير ژن S1 نشان داد كه ميزان كلي عفونت 65-70% بود و اين ژنوتيپ‌ها با اين درصد مشخص شد: (واريانت2 (IS/1494), 52.3%، 793/B  33.5% , MASS 9.5%، QX 4.7% )