معرفي گونه‌هاي قارچ Fusarium همراه بذر برنج در استان‌هاي فارس و خوزستان

در جريان بازديد از شاليزارهاي برنج استان هاي فارس و خوزستان در مرحلۀ سفت شدن دانه ، 42 نمونه بذر گرد آوري شد. براي جداسازي Fusariumاز نمونه ها، بذرها روي محيط غذايي اختصاصي فوزاريوم (PeptonPCNBAgar, PPA) به دو روش ضدعفوني با محلول هيپوكلريت سديم 1درصد و بدون ضدعفوني كشت و در انكوباتور (اتاقك رشد) با دماي 1±25 درجۀ سلسيوس و نور متناوب (روشنايي و تاريكي) نگهداري شدند. 26 جدايه بر اساس ويژگي‌هاي ريخت شناختي روي محيط‌هاي كشت PDA، CLAو SNAو استفاده از منابع معتبر شناسايي شد. همچنين ارزيابي فيلوژنيك (تبارزايي) 18 و 6 جدايۀ منتخب بر اساس توالي ناحيۀ ژني TEF1αو توالي نوكلئوتيدي ناحيۀ ITSانجام گرفت. نتايج نشان داد، جدايه هاي Fusariumمورد بررسي، متعلق به دو گونۀ مركب FIESC(Fusarium incarnatumequiseti species complex) و GFSC(Gibberella fujikuroi species complex)، به ترتيب با فراواني50 و 46 درصد بودند. F. fujikuroiدر استان فارس و F. semitectumدر استان خوزستان بيشترين فراواني را داشتند. در اين تحقيق دو گونۀ F. fujikuroiو F. andiyaziمتعلق به گونۀ مركب  GFSCبر اساس توالي ژن TEF1α، در دو كلاد مجزا تفكيك شدند. توالي يابي ناحيۀ ژني TEF1αبراي تفكيك و شناسايي اعضاي گونۀ مركب  GFSCمفيد است اما توالي ناحيۀ ITSنتوانست اين گونه ها را شناسايي و از همديگر تفكيك كند. تك جدايۀ F. merismoidesكه بر اساس ويژگي‌هاي ريخت شناختي شناسايي شد، توسط توالي ژن TEF1αشناسايي نشد اما در درخت فيلوژنيك رسم‌شده بر اساس توالي ناحيۀ  ITSاز جنس Fusariumتفكيك و به جنس Fusicollaو گونۀ F. acetilereaمنتقل شد.