تجزيه ارتباط براي مقاومت به بيماري پوسيدگي اسكلروتينيايي يقه ساقه در آفتابگردان (Helianthus annuus L.) با استفاده از نشانگرهاي رتروترنسپوزوني REMAP

Associated analyses for resistance to sclerotinia stem rot disease in sunflower (Helianthus annuus L.) using retrotransposon-based (REMAP) markers

آفتابگردان يك محصول مهم زراعي مي‌باشد كه روغن آن ارزش غذايي و اقتصادي بالايي دارد. اسكلروتينيا از بيماري‌هاي قارچي مهم آفتابگردان مي‌باشد كه باعث كاهش رشد و عملكرد محصول مي‌شود. در پژوهش حاضر واكنش 100 لاين خالص آفتابگردان روغني به 6 جدايه قارچ اسكلروتينيا مورد بررسي قرار گرفت. براي شناسايي مكان‌هاي ژني پيوسته با مقاومت به بيماري از 120 جايگاه ژنومي تكثير شده توسط آغازگرهاي رتروترنسپوزوني REMAP استفاده شد. نتايج نشان داد كه برخي ژنوتيپ‌هاي آفتابگردان مقاومت خوبي به بيماري اسكلروتينيا دارند. ژنوتيپ 8A×/LC1064C كمترين درصد آلودگي را در پاسخ به دو جدايه قارچيA37 (S. sclerotiorum) و M1 (S. minor) از دو گونه مختلف قارچ اسكلروتينيا نشان داد. در تجزيه ساختار جمعيت با نرم‌افزارStructure ، 4 زيرجمعيت احتمالي شناسايي شد. در تجزيه ارتباط با نرم‌افزارTASEEL به دو روشGLM وMLM ، به ترتيب 9 و 8 مكان ژني شناسايي شد كه ارتباط معني‌داري (P≤0.01) با ژ‌ن‌هاي كنترل‌ كننده مقاومت به بيماري دارند. طبق نتايج، نشانگرهاي CF-UBC826، 1061LTR-UBC818 و 1061LTR-UBC857 با ژن‌هاي كنترل كننده مقاومت به دو جدايه‌ قارچ عامل بيماري پيوسته بودند. نشانگرهاي شناسايي شده در اين تحقيق، در صورت تاييد و تبديل به نشانگر SCAR مي توانند بطور موثري در برنامه‌هاي گزينش به كمك نشانگر و توليد ارقام مقاوم به بيماري اسكلروتينيا مورد استفاده قرار بگيرند.

Sunflower is an important crop that its oil has nutritional and high economic value. Sclerotinia is important fungal disease of sunflower that reduces its growth and yield. In this study, the reaction of 100 oily sunflower lines was studied to 6 fungal isolate of sclerotinia disease. Identification of gene loci related to resistance for disease was done with 120 retrotransposon-based primers (REMAP) locus. The results showed that some sunflower genotypes had the good resistant to sclerotinia disease. 8A×/LC1064C genotype showed low necrosis percentage against two A37 (S. sclerotiorum) and M1 (S. minor) isolates. In population structure analysis, 4 subpopulations were identified (K=4) using STRUCTURE software. As well as in associated analysis based on general and mixed linear models (GLM and MLM) using TASEEL software, 9 and 8 loci were identified respectively that are significant association (P≤0.01) with resistant genes that related to sclerotinia. According to the results, CF-UBC826, 1061LTR-UBC818 and 1061LTR-UBC857 markers were commonly related to the resistant genes to some fungal isolate. Identified markers after validation and tranfering to SCAR markers can be used important in sunflower breeding programs for marker-assisted selection (MAS) and developing resistant cultivars to sclerotinia disease.