بررسي تنوع ژنتيكي اكوتيپ‌هاي پنيرك (Malva neglecta) با استفاده از نشانگر مولكولي ISSR

در اين تحقيق، تنوع ژنتيكي 18 اكوتيپ پنيرك (Malva neglecta) تهيه شده از بانك ژن سازمان جنگل‌ها و مراتع مورد ارزيابي قرار گرفت. با استفاده از روش CTAB استخراج DNA صورت گرفت و با 15 نشانگر ISSR تنوع ژنتيكي مورد بررسي قرار گرفت. آغازگر‌هاي ISSR در مجموع توانستند 99 باند توليد كنند كه از اين تعداد، 2 باند يك شكل مشاهده شد. آغازگرهاي IS5 و IS6 به‌ترتيب با 12 و 11 باند بيشترين تعداد و آغازگرهاي UBC807 و UBC867با 4 باند كمترين تعداد باند را نشان دادند. شاخص-هاي محتواي اطلاعات چند شكلي (PIC)، شاخص نشانگري (MI)، نسبت چندگانه موثر (EMR) و شاخص قدرت تفكيك (RP) براي كليه نشانگرها محاسبه گرديد كه با توجه به شاخص‌هاي محاسبه شده آغازگرهاي IS5 و IS6 به عنوان بهترين آغازگرها جهت بررسي تنوع ژنتيكي پنيرك معرفي گرديد. ميزان شباهت ژنتيكي مشاهده شده براساس اطلاعات اين نشانگرها برابر 69/0 بود. بيشترين تشابه را اكوتيپ‌ 4G با اكوتيپ ‌9G با ضريب 84/0 داشتند. كمترين تشابه مربوط به اكوتيپ 1G با اكوتيپ‌هاي 9G، اكوتيپ 15G با 6G و 8G با ضرايب تشابه 57/0 بود. نتايج حاصل از گروهبندي تجزيه خوشه‌اي به روش UPGMA بر اساس ضريب تشابه جاكارد اكوتيپ‌ها را در 3 گروه قرار داد كه بر اساس تجزيه به مختصات اصلي (PCo) و تجزيه واريانس مولكولي (AMOVA) گروه‌هاي حاصل از تجزيه كلاستر تاييد گرديد بر طبق اين گروهبندي واريانس بين گروه‌ها در سطح 5% معني‌دار بود، اما براساس واريانس برآورد شده سهم واريانس بين گروه‌ها تنها 29 درصد از تنوع كل بود.

In this research, the genetic diversity of 18 malva (Malva neglecta) from the gene bank of forests and rangelands was evaluated. DNA extraction was performed using CTAB method, and genetic variation was investigated with 15 ISSR markers. All of the ISSR primers showed 99 visible bands in which four bands were similar patterns. The IS5 and IS6 primers had the most number of bands with 12 and 11 bands respectively, while UBC807 and UBC867 with two bands showed the least band numbers. The Polymorphic information content (PIC), marker index (MI), EMR and RP indices were calculated for all primers. With this point of view, IS5 and IS6 were the best primers to identify variability among these Malva. Total genetic similarity based on these primers was 69 percent. The greatest genetic similarity was between G4 with ‌G9 ecotype. The lowest genetic distance was between G1 and G9 ecotype. Cluster analysis based Jakard coefficient by UPGMA was classified all genotype to tree groups and this clustering was confirmed by principal coordinate (PCo) and analysis of molecular variance (AMOVA). Portion of between group variance was just 29 percent of total variance.