رديابي مولكولي ويروس‌هاي زردي رگبرگ خيار و كوتولگي زرد كدوئيان در جنوب شرق ايران و آناليز ژنتيكي جدايه از CVYV

بيماري‌هاي زردي ناشي از ويروس‌هاي قابل انتقال با سفيدبالك در مزارع كدوئيان اهميت زيادي داشته و به كدوئيان مناطق وسيعي از جهان خسارت زيادي وارد مي‌كنند. در تحقيق حاضر، از مزارع مختلف كدوئيان در جنوب شرق (سيستان و بلوچستان) 195 نمونه طي تابستان و زمستان سال‌هاي 96-1395، با علايم مانند: زردي، كوتولگي و بدشكلي برگها جمع آوري شد. به‌منظور رديابي ويروس‌هاي زردي رگبرگ خيار و كوتولگي زرد كدوئيان، با استفاده از آغازگر شش نوكلئوتيدي تصادفي و آر ان اي كل استخراج‌شده از نمونه‌هاي گياهي، cDNA تهيه شد. سپس آزمون پي سي آر با استفاده از cDNA سنتز شده و آغازگرهَاي اختصاصي منطبق با بخشي از ژن رمزكننده پروتئين پوششي (CV+/CV- و CYSCPF/CYSCPF) انجام گرديد. نتايج حاصل نشان داد در 55 نمونه مشكوك قطعه450 جفت بازي و در 17 نمونه، قطعه700 جفت بازي مربوط به بخشي از ژن رمز كننده پروتئين پوششي ويروس‌هاي CVYV وCYSDV به ترتيب تكثير شدند. توالي نوكلئوتيدي ژن پروتئين پوششي مربوط به دو جدايه ويروس CVYV تعيين شد. توالي پروتئين پوششي دو جدايه با يكديگر و با 17جدايه ديگر قابل دسترسي در بانك ژن مقايسه گرديد. براساس مطالعات تبارزايي جدايه‌هاي CVYV به دو گروه اصلي I (زيرگروه‌هاي IA و IB) و II تقسيم شدند: گروه اول شامل جدايه‌هاي از لبنان، اردن، تونس، اسپانيا و فرانسه اما گروه دوم تنها شامل جدايه‌ها‌ي ايران (چابهار و زهك) بود كه نشان دهنده تنوع بالاي اين جدايه‌ها است. نتايج شاخص‌هاي تنوع ژنتيكي و انتخاب نشان داد: جريان ژني از اروپا به آسيا بسياركم و تفاوت ژنتيكي بين آن‌ها زياد است و منطقه CP تحت محدوديت‌هاي شديد انتخاب منفي است كه باعث تنوع و تكامل گونه CVYV شده است. به‌طور كلي، براساس نتايج بيشترين تنوع مولكولي و ميزباني مربوط به گروه آسيا است.

Yellowing diseases of field and greenhouse-grown cucurbits caused by whitefly-transmitted viruses are increasingly becoming important and cause economic losses in many cucurbits growing areas of the world. In this research, 195 samples with symptoms yellowing, stunting and deformation of leaves were collected from fields of cucurbits in the South-East Iran (Sistan and Baluchestan). In order to detect CVYV and CYSDV, cDNAs were prepared using Random Hexamer primer and total RNAs extracted from the collected samples.Then, Polymerase Chain Reaction (PCR) was performed using exteracted RNA and specific primers (CYSCPf and CYSCPr for CYSDV, CV+ and CV- for CVYV). The results revealed that a 450 bp fragment from the CVYV-CP and a 700 bp fragment from CYSDV-CP were amplified from 55 and 17 samples, respectively. About 7% of the samples had simultaneous contamination with the two viruses. Based on the Phylogenetic studies CVYV were divided into two main groups I (subgroups IA and IB) and II: the first group belongs of isolates from Lebanon and Jordan, Tunisia and Spain, but the second group contained only isolates of Iran (Chabahar) which indicates the high diversity of this isolate. The results of the genetic diversity and selection indices showed that the gene flow from Europe to Asia is very small and the genetic difference is high between them. The CP region is under severe pressure a negative choice, and has caused variation and evolution of the CVYV. Generally, based on the results, the most diversity molecular and host are in Asia group.