پديد آورندگان :
لركي، ريحانه دانشگاه شهيد چمران اهواز - مركز تحقيقات بيوتكنولوژي و علوم زيستي , مهرابي كوشكي، مهدي دانشگاه شهيد چمران اهواز - مركز تحقيقات بيوتكنولوژي و علوم زيستي , فرخي نژاد، رضا دانشگاه شهيد چمران اهواز - مركز تحقيقات بيوتكنولوژي و علوم زيستي
كليدواژه :
قارچ‌هاي همراه , ريخت‌شناسي , فيلوژني مولكولي , بتاتوبولين , Chaetomiaceae
چكيده فارسي :
مقدمه: گياهان زينتي آهار (Zinnia elegans)، اختر (Canna sp.)، اطلسي (Petunia hybrida)، كمپكت (Dracaena Compacta)، كوكب (Dahlia sp.)، گازانيا (Gazania sp.)، گل جعفري (Tagetes sp.)، گلناز (Portulaca grandiflora) و لادن (Tropaeolum majus) از گياهان زينتي در شهر اهواز ميباشند. شناسايي قارچ‌هاي همراه اين گياهان به بهبود مديريت پرورش آن‌ها در آينده كمك خواهد كرد. اعضاي جنس‌هاي Amesia و Chaetomium عموما در خاك، آب، گياهان، حيوانات و انسان يافت شده‌اند. در اين مطالعه، 12 جدايه از جنس‌هاي Chaetomium و Amesia، جداسازي شده از گياهان زينتي علفي، بر اساس ريخت‌شناسي و تجزيه و تحليل تبارشناسي شناسايي شدند.
مواد و روشها: در طول سال‌هاي 97-1396، 40 نمونه از گياهان فوق با علايم پوسيدگي ريشه، شانكر ساقه و لكه‌برگي جمع‌آوري و قارچ‌هاي همراه اين علايم جداسازي شد. در بين آن‌ها، 12 جدايه از خانواده Chaetomiaceae بدست آمد كه مشخصات ريخت‌شناسي و مولكولي آن‌ها مورد بررسي قرار گرفت. جدايههاي قارچي در محيط كشت سيبزميني- دكستروز - بروث (PDB) رشد يافته و زيستتوده ميسيليومي آن‌ها، پس از عبور از كاغذ سترون جمع‌آوري و سپس خشك - انجمادي گرديد. نواحي ITS و بخش‌هايي از ژن‌هاي 28S-D1/D2 (براي چهار جدايه) و tub2 (براي نه جدايه) با استفاده از آغازگرهاي مناسب تكثير و توالي‌يابي شدند.
نتايج: جدايههاي تحت مطالعه با سويه‌هاي شناخته‌شده، با استفاده از الگوريتم جستجوي بلاست و تجزيه و تحليل تبارشناسي مبتني بر ناحيه‌هاي ITS، 28S و tub2، مقايسه شدند. بر اين اساس، گونه‌هاي Chaetomium olivaceum، C. ascotrichoides ،C. globosum ، C. rectangulare و Amesia atrobrunnea شناسايي گرديدند. مشخصات ريخت‌شناسي اين جدايه‌ها با سويه‌هاي تايپ هر گونه انطباق داشت.
بحث و نتيجهگيري: بر اساس دانش ما، اين اولين گزارش گونه‌ي C. ascotrichoides در ايران و همراهي C. rectangulare روي كمپكت،C. globosum روي آهار و اختر، C. ascotrichoides روي اطلسي وC. olivaceum روي آهار، لادن و جعفري در جهان مي‌باشد.
چكيده لاتين :
Introduction: Common zinnia (Zinnia elegans), canna (Canna sp.), petunia (Petunia hybrida), compacta (Dracaena Compacta), dahlia (Dahlia sp.), gazania (Gazania sp.), marigold (Tagetes sp.), rose moss (Portulaca grandiflora) and nasturtium (Tropaeolum majus) are common ornamental plants in Ahvaz. The identification of fungi associated with these plants will contribute to improving the future managment of their cultivation. Members of the genera Amesia and Chaetomium are widely distributed in soil, water, plants, animals and humans. In this study, 12 isolates from Chaetomium and Amesia genera, obtained from herbaceous ornamentals, were identified based on morphology and phylogenetic analysis.
Materials and methods: During 2017-2018, 40 symptomatic plants, showing root rot, stem canker and leaf spot, were collected and their associated fungi were isolated. Among those, 12 chaetomiaceae-like isolates were obtained, which their morphological and molecular characterizations were surveyed. Mycelial biomass of the isolates, produced into potato-dextrose-broth (PDB), was collected by passing through filter paper and freeze-dried. ITS and partial regions of the 28s-D1/D2 (for 4 isolates) and tub2 (for 9 isolates) were amplified using appropriate primers and sequenced.
Results: The isolates under survey were compared with known strains using BLASTn search and phylogenetic analysis beased on ITS, 28S and tub2 regions. Accordingly, the isolates under study were identified as follow: Amesia atrobrunnea, Chaetomium rectangulare, C. globosum, C. ascotrichoides and C. olivaceum. The morphological characteristics of these isolates were in accordance with the type strains of each species.
Discussion and conclusion: To our knowledge, this is the first record of C. ascotrichoides in Iran and the association of C. rectangulare on compacta, C. globosum on zinnia and canna, C. ascotrichoides on petunia, C. olivaceum on common zinnia, nasturtium and marigold throughout the world.
