عنوان مقاله :
تكنيكِ نسل جديد توالييابي و كاربرد آن در ويروسشناسي گياهي
عنوان به زبان ديگر :
Next Generation Sequencing Technique and Its Application in Plant Virology
پديد آورندگان :
داودي، زهره دانشگاه شهيد باهنر كرمان - دانشكده كشاورزي - بخش گياهپزشكي , حيدرنژاد، جهانگير دانشگاه شهيد باهنر كرمان - دانشكده كشاورزي - بخش گياهپزشكي , معصومي، حسين دانشگاه شهيد باهنر كرمان - دانشكده كشاورزي - بخش گياهپزشكي
كليدواژه :
توالييابي دياِناِ , ويروئيد , illumina/solexa , ويروس
چكيده فارسي :
تعيين توالي دياِناِ در همه شاخههاي علوم زيستي كاربرد دارد. در ميان اولين فنآوريهاي پيشرفته نسل توالييابي، دانشمندان با ظهور توالييابي سنگر، توانستند اطلاعات ژنتيكي گونهها را در هر سيستم بيولوژيكي مشخص كنند. اگرچه هنوز هم اين تكنيك بهدليل كيفيت تواليهاي خوانده شده، مورد توجه است، اما محدوديت هايي چون مقياس كار، سرعت و تفكيكپذيري موانعي است كه مانع دسترسي دانشمندان به اطلاعات اساسي مورد نياز شده است. براي غلبه بر اين موانع، فنآوري توالييابي نسل جديد (ngs) در شروع قرن 21 ارائه شد. اين فنآوري، توالييابي بسيار كارآمد، سريع و كم هزينه را نسبت به فنآوري استاندارد و سنتي توسعه يافته در اواخر دهه 1970، فراهم نمود. در سال 2009 فنآوري ngs براي چندين جنبه ويروسشناسي گياهي از جمله توالييابي ژنوم، كشف و رديابي، اكولوژي، اپيدمولوژي و تكثير ويروسها و ويروئيدها استفاده شد. انتظار ميرود كه فنآوري ngs نقش بسيار مهمي در بسياري از تحقيقات ويروسشناسي گياهي داشته باشد.
چكيده لاتين :
DNA sequencing is used by virtually all branches of biological research. Among the first advanced sequencing technologies, scientists were able to elucidate genetic information from any particular biological system using the Sanger sequencing method. Although Sanger sequencing generates high quality sequencing data, its limitations such as scalability, speed and resolution often preclude scientists from obtaining the essential information. To overcome these barriers, next generation sequencing technique (NGS) was introduced at the beginning of the 21st century. This technique provided a highly efficient, rapid, and low cost DNA sequencing platform beyond the reach of the standard and traditional DNA sequencing technologies that developed in late 1970s. In 2009, NGS technologies began to be applied to several areas of plant virology including virus/viroid genome sequencing, discovery and detection, ecology, epidemiology and replication. It is expected that NGS plays very significant roles in many plant virology researches.
عنوان نشريه :
دانش بيماري شناسي گياهي