عنوان مقاله :
تعيين ژنوتايپ گونههاي آكانتامبا جداسازي‌شده از خاك شهرستان ورامين، ايران
عنوان به زبان ديگر :
Genotyping of Acanthamoeba Isolated from Soil in Varamin City, Iran
پديد آورندگان :
محمد نجار، محمد دانشگاه تربيت مدرس - دانشكده علوم پزشكي - گروه انگل شناسي و حشره شناسي پزشكي، تهران، ايران , غفاري فر، فاطمه دانشگاه تربيت مدرس - دانشكده علوم پزشكي - گروه انگل شناسي و حشره شناسي پزشكي، تهران، ايران , دليمي اصل، عبدالحسين دانشگاه تربيت مدرس - دانشكده علوم پزشكي - گروه انگل شناسي و حشره شناسي پزشكي، تهران، ايران
كليدواژه :
آكانتامبا , ژنوتايپ T4 , خاك , شهر ورامين
چكيده فارسي :
اهداف: خاك يكي از منابع مهم آلودگي انسان به آكانتامبا است. با توجه به افزايش موارد كراتيت آميبي در سال‌هاي اخير در ايران، توجه بيشتري نسبت به بررسي اين آميب در حال حاضر شده است. مطالعه حاضر با هدف جداسازي گونههاي آكانتامبا با استفاده از روش واكنش زنجيره‌اي پليمراز (PCR) و تعيين ژنوتايپ‌هاي آنها در شهر ورامين انجام شد.
مواد و روش‌ها: به‌طور كلي 18 نمونه از 12 پارك شهر ورامين جمع‌آوري شد. نمونه‌ها از فيلترهاي نيتروسلولز 0/45ميكروني عبور داده شدند. پس از فيلتركردن نمونه‌ها، آنها روي محيط آگار غيرمغذي 1/5% همراه با باكتري اشريشيا كلي كشته‌شده كشت داده شدند. DNA ژنوميك با محلول DNG-plusTM از پليت‌هاي مثبت استخراج شد و با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي 18S rRNA با تكثير قطعه 500جفت بازي به روش PCR مورد شناسايي قرار گرفت. نمونه‌هاي مثبت براي تعيين ژنوتايپ، تعيين ترادف شدند.
يافته‌ها: از 18 نمونه خاك، 6 ايزوله (33/3%) آكانتامبا، در محيط كشت از نظر مورفولوژي شناسايي شدند كه از اين تعداد 4 ايزوله (22/2%) با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي جنس آكانتامبا تاييد شدند. ژنوتايپ تمامي نمونه‌ها T4 گزارش شد.
نتيجه‌گيري: با توجه به اين نتيجه، خاك پارك‌ها احتمال دارد يك عامل خطر براي افراد، مخصوصاً كودكان در اين منطقه باشد. از اين رو، توجه بيشتري به نكات بهداشت عمومي توصيه مي‌شود.
چكيده لاتين :
Aims The soil is one of the important sources of Acanthamoeba human infection. Regarding the
increasing number of Acanthamoeba keratitis cases in recent years in Iran, more attention to
investigating this amoeba now is made. The present study aimed to identify the genotypes of
Acanthamoeba in Varamin City using polymerase chain reaction (PCR) technique.
Materials & Methods Totally, 18 samples of soil were collected from 12 parks in Varamin
City. The samples were filtered using 0.45μm nitrocellulose membrane filters. Then, they
were cultured in non-nutrient agar medium 1.5% enriched with killed cultured bacteria
Escherchia coli. Genomic DNA was extracted by DNG-plusTM solution and PCR amplification
was performed using specific primers to amplify a 500bp 18S rRNA. Sequencing analysis and
BLAST search were done for genotype identification of positive samples.
Findings Out of 18 soil samples, 6 isolates (33.3%) were found to be positive for Acanthamoeba
in medium by microscopic observation meanwhile 4 isolates (22.2%) were confirmed by
Acanthamoeba genus-specific primers. Genotype identification was revealed that all samples
belonged to T4 type.
Conclusion Considering this result, the soil of parks is possible be a risk factor for people,
particularly children in this area. Therefore, more attention of public health authorities is
recommended.
عنوان نشريه :
پژوهش هاي آسيب شناسي زيستي
