شناسايي سريع ايزوله هاي انتروكوكوس فكاليس با استفاده از واكنش زنجيره اي پلي مراز(pcr)

Rapid Identification of Enterococcus Faecalis Isolates by Polymerase Chain Reaction

انتروكوكوس فكاليس به عنوان يك پاتوژن مهم در عفونت هاي بيمارستاني مطرح مي باشد. شناسايي سريع انتروكوكوس فكاليس در عفونت هاي خطرناك به خصوص در افراد با نقص ايمني مسئله مهمي به شمار مي رود. هدف از انجام اين مطالعه بررسي كارايي ژن ef0737 در شناسايي ايزوله هاي انتروكوكوس فكاليس و گونه هاي مشابه شامل انتروكوكوس فيسيوم و استافيلوكوكوس اورئوس مي باشد.مواد و روش ها: در اين مطالعه مقطعي 150 ايزوله باليني شامل 50 ايزوله انتروكوكوس فكاليس‌‌‌، 50 ايزوله انتروكوكوس فيسيوم و 50 ايزوله استافيلوكوكوس اورئوس از منابع مختلف عفونت جمع آوري شد. طراحي پرايمر با استفاده از توالي ژن ef0737 انجام شد و همه ايزوله ها از نظر حضور ژنef0737 با استفاده از روش واكنش زنجيره اي پلي مراز (pcr) مورد بررسي قرار گرفتند. حساسيت pcr بر اساس ايزوله هاي باليني انتروكوكوس فكاليس و اختصاصيت پرايمرها بر اساس ايزوله هاي غير انتروكوكوس فكاليس شامل 50 ايزوله انتروكوكوس فيسيوم و 50 ايزوله استافيلوكوكوس اورئوس بررسي شد.يافته ها: در اين مطالعه از مجموع 150 ايزوله باليني ( 50 ايزوله انتروكوكوس فكاليس، 50 ايزوله انتروكوكوس فيسيوم و 50 ايزوله استافيلوكوكوس اورئوس ) همه ايزوله هاي انتروكوكوس فكاليس از نظر حضور ژن ef0737 مثبت و حساسيت تست 100% محاسبه شد. همچنين ايزوله هاي انتروكوكوس فيسيوم و استافيلوكوكوس اورئوس همگي از نظر حضور ژن ef0737 منفي شدند كه نشانگر اختصاصيت پرايمرها بود.نتيجه گيري: pcr بر اساس نتايج اين مطالعه يك روش حساس و كاربردي در شناسايي سريع انتروكوكوس فكاليس به خصوص در بيماران با شرايط بحراني مي باشد. شناسايي ژن حفاظت شده ef0737 در نمونه هاي باليني احتمالا منجر به تشخيص سريع عفونت ناشي از انتروكوكوس فكاليس مي شود.

Rapid detection of Enterococcus faecalis as a frequent cause of nosocomial infections in immunocompromised patients is an important issue. Herein, the current study developed a PCR assay based on the ef0737 gene to detect E. faecalis isolates. METHODS In this cross-sectional study, 150 clinical isolates including E. faecalis, E. faecium and Staphylococcus aureus were collected. A set of pair primers was designed using the sequence of ef0737. All isolates were examined for the presence of ef0737 gene by PCR assay. The sensitivity of PCR assay was evaluated according to 50 clinical isolates of E. faecalis. The specificity of PCR primers was also determined using non-E. faecalis species including 50 E. faecium and 50 S. aureus isolates. FINDINGS In this study, from 150 clinical isolates that were collected; all the 50 E. faecalis isolates showed positive results for the ef0737 gene which showed 100% sensitivity. No amplification were observed in other isolates include E. faecium and S. aureus. CONCLUSION PCR assay is a more efficient and sensitive tool for detection and characterization of E. faecalis especially in patients with the critical condition. Identification of the preserved ef0737 gene in clinical samples may be able to determine infections caused by E. faecalis.