عنوان به زبان ديگر :
Identification of Dermatophytosis Agents in Mashhad, Iran, by Using Polymerase Chain Reaction Sequencing (PCR Sequencing) Method
پديد آورندگان :
نجاتي حسيني، راحله دانشگاه علوم پزشكي مشهد - دانشكده ي پزشكي - گروه انگل شناسي و قارچ شناسي , زرين فر، حسين دانشگاه علوم پزشكي مشهد - مركز تحقيقات آلرژي , پريان، محمود دانشگاه علوم پزشكي مشهد - دانشكده ي پزشكي - گروه انگل شناسي و قارچ شناسي , پرهام، سعيد دانشگاه علوم پزشكي مشهد - دانشكده ي پزشكي - گروه انگل شناسي و قارچ شناسي , فتي، عبدالمجيد دانشگاه علوم پزشكي مشهد - دانشكده ي پزشكي - گروه انگل شناسي و قارچ شناسي , رضائي مته كلائي، علي دانشگاه علوم پزشكي جندي شاپور اهواز - دانشكده ي پزشكي - گروه قارچ شناسي پزشكي , نجف زاده، محمدجواد دانشگاه علوم پزشكي مشهد - دانشكده ي پزشكي - گروه انگل شناسي و قارچ شناسي
چكيده فارسي :
مقدمه: درماتوفيت‌ها، گروهي از قارچ‌ها هستند كه بافت‌هاي كراتينه‌ي پوست، مو و ناخن را در انسان و حيوان مورد حمله قرار مي‌دهند و عفونت‌هايي تحت عنوان درماتوفيتوزيس (كچلي) ايجاد مي‌كنند. از آن جايي كه شناسايي قارچ‌هاي پاتوژن در سطح گونه جهت رديابي منبع عوامل ايجاد كننده، كنترل و پيش‌گيري و اپيدميولوژي عفونت حايز اهميت است، استفاده از روش‌هاي تشخيصي اختصاصي و حساس براي شناسايي عوامل درماتوفيتوزيس ضروري به نظر مي‌رسد.
روش‌ها: نمونه‌هاي باليني (پوسته، ناخن و مو) مبتلايان به درماتوفيتوزيس در شهر مشهد بر روي محيط كشت مايكوزيل آگار كشت داده شد و سپس، ژنوم كلني‌هاي درماتوفيت‌هاي به دست آمده، توسط كيت مخصوص استخراج گرديد. ژن Internal transcribed spacer (ITS) توسط پرايمرهاي ITS1 و ITS4، تكثير و سپس، تعيين توالي آن‌ها انجام شد. در نهايت، نتايج توالي‌ها با نرم‌افزار SeqMan، آناليز گرديد و جواب آن‌ها با موارد موجود در پايگاه داده‌اي قارچي هلند مقايسه شد.
يافته‌ها: 80 ايزوله‌ي درماتوفيتي در اين مطالعه تعيين توالي شدند كه شامل 9 گونه‌ي درماتوفيتي و عبارت از 23 مورد (28/8درصد) Trichophyton interdigitale، 18 مورد (22/5 درصد) Trichophyton tonsurans، 10 مورد (12/5 درصد) Epidermophyton floccosum، 10 مورد (12/5 درصد) Trichophyton mentagrophytes، 8 مورد (10/0 درصد) Microsporum canis، 4 مورد (5/0 درصد) Trichophyton rubrum ، 4 مورد (5/0 درصد) Arthroderma benhamiae ، 2 مورد (2/5 درصد) Nannizzia fulva و 1 مورد (1/2 درصد) Nannizzia persicolor بودند.
نتيجه‌گيري: با توجه به گزارش گونه‌هاي نادر درماتوفيت در اين مطالعه، استفاده از روش‌هاي مولكولي نظير تعيين توالي ژن ITS مي‌تواند تنوع گونه‌اي درماتوفيت‌ها در يك منطقه را با دقت بيشتري نسبت به روش‌هاي ريخت‌شناسي (Morphology) تعيين كند.
چكيده لاتين :
Background: Dermatophytes are a group of fungi that attack keratinous tissues of the skin, hair, and nail in
humans and animals, and cause infections called dermatophytosis (tinea). Since identification of pathogenic
fungi at the species level is essential for the detection of the source, control and prevention, and identifying
epidemiology of infection, it is necessary to use specific and sensitive diagnostic methods to identify the causes
of dermatophytosis.
Methods: The clinical samples (skin, nail, and hair) of patients with dermatophytosis in Mashhad City, Iran, were
cultured in Mycosyl Agar culture media, and the DNA of obtained dermatophyte colonies were extracted by
specific kit. The internal transcribed spacer (ITS) gene was amplified and sequenced by ITS1, ITS4 primers.
Finally, the sequencing results were analyzed using SeqMan software, and were compared with the data of the
global genebank.
Findings: In this study, 80 dermatophyte isolates were sequenced, which included 9 dermatophyte species as
23 (28.8%) Trichophyton (T.) interdigital, 18 (22.5%) T. tunsorans, 10 (12.5%) Epidermophyton fluccosum,
10 (12.5%) of T. mentagrophytes, 8 (10%) Microsporum canis, 4 (5%) T. rubrum, 4 (5%) T. benhamiae, 2 (2.5%)
Nannizzia (N.) fulvum, 1 (1.2%) N. persicolor.
Conclusion: According to report the rare species of dermatophytes in this study, the use of molecular methods
such as sequencing of the ITS gene can determine the diversity of dermatophytes in a region more precisely than
morphological methods.
