تشخيص مايكروباكتريوم به روش‌هاي مولكولي و كشت از بخش مراقبت‌هاي ويژه بيمارستان TELANGANA

Detection of Mycobacterium tuberculosis - Microscopy to Molecular Techniques at the Tertiary Care Hospital in Telangana

زمينه و اهدف: بيماري سل همه‌ساله بيشتر از يك ميليون نفر را در ميان كشورهاي با درآمد كم و يا متوسط مي‌كشد. درك روند وقوع، شيوع و مرگ‌ومير توبركلوز (سل) براي پيگيري موفقيت در برنامه‌هاي كنترل آن بسيار مهم است. تشخيص ميكروبيولوژيكي بيماري‌هاي ناشي از مايكوباكتري‌ها بايد سريع و مؤثر باشد تا از ابتلا به بيماري جلوگيري و مديريت عفونت را بهينه كند. مواد و روش كار: درمجموع، 1412 نمونۀ باليني سل ريوي و خارج ريوي از ژانويه تا دسامبر 2017 در انستيتوي علوم پزشكي نظام، حيدرآباد، پاكستان، مطالعه شد. تمام نمونه‌ها مطابق رويه‌هاي عملياتي استاندارد پردازش شدند. تمام نمونه‌ها با ميكروسكوپ، كشت، و با كمك دستگاه تشخيص مولكولي GeneXpert بررسي شدند. يافته‌ها: از 1412 نمونۀ دريافت‌شده 813 نفر مرد (57/6%) و 599 زن (42/4%) بودند. از بين اين نمونه‌ها، 818 مورد (57/9%) نمونۀ سل ريوي و 594 نمونۀ خارج ريوي وجود داشت. شيوع مايكوباكتريوم 6/21% بود كه از اين تعداد مايكوباكتريوم توبركلوزيس در 3/18% و مايكوباكتريوم‌هاي غير توبركولوز (25/3%) مشاهده شد. ميزان آلودگي 2/6% (37 مورد از 1412) بود. در ميان موارد مثبت، شايع‌ترين گروه سني مبتلا 30-21 سال (22/2%) بود. حدود 64 نفر (4/43 درصد) اسمير مثبت داشتند. در مجموع 200 ايزوله (16/14%) باحداقل يك سيستم كشت LJ يا سيستمBacT Alert 3D بازيابي شدند. MTB در 216 (15/29) توسط GeneXpert بازيابي شد. MDRTB در 8 (3/7%) توسط GeneXpert تشخيص داده شد. نتيجه‌گيري: كمپلكس مايكوباكتريوم توبركلوزيس مسئول عوارض و مرگ و مير عظيمي در سراسر جهان است. تاخير در تشخيص ممكن است استفاده از درمان مناسب را به تعويق اندازد و براي بيمار مضر باشد. به دليل طولاني بودن زمان كشت سنتي، تكنيك‌هاي جديد مولكولي امكان تشخيص سريع آزمايشگاهي و حساستر توبركلوزيس را فراهم مي‌كند.

Background and Aims: Tuberculosis kills more than 1 million people every year, most of them in low-income and middle-income countries. An understanding of the trends in tuberculosis incidence, prevalence, and mortality s crucial to track the success of tuberculosis control programs. Microbiological diagnosis of diseases caused by Mycobacteria should be fast and effective to prevent contagions and optimize the management of infections. Materials and Methods: A total of 1412 clinical pulmonary and extra pulmonary specimens were studied from January 2017 to December 2017 at Nizamchr('39')s Institute of Medical Sciences, Hyderabad. All specimens were processed according to standard operating procedures. All the specimens were subjected to microscopy, culture, GeneXpert. Results: Among 1412 samples received 813 were males (57.6%) and 599 females (42.4%). Among these 818 (57.9%) were pulmonary samples and 594 extra pulmonary samples. Mycobacterium prevalence was (21.6%) out of which Mycobacterium tuberculosis was found in 18.3% and Non tuberculous Mycobacteria (3.25%). The contamination rate was 2.6% (37 out of 1412). Among the positives, the most common affected age group was 21-30 yrs (22.2%). About 64 (4.53%) were smear positive. A total of 200 isolates (14.16%) were recovered by at least one culture LJ medium or BacT Alert 3D system. MTB was recovered in 216 (15.29%) by GeneXpert. MDRTB was detected in 8 (3.7%) by GeneXpert. Conclusion: M. tuberculosis complex is responsible for immense worldwide morbidity and mortality. Delays in diagnosis may postpone administration of appropriate treatment and be detrimental to patient outcomes. Since traditional culture methods are slow, newer molecular techniques allow more rapid and sensitive laboratory diagnosis of tuberculosis.