مطالعه نيمرخ بياني در گياه اسطوخودوس انگليسي تحت تنش خشكي با روش توالي يابي رونوشت ها

هدف: خشكي از مهمترين عوامل محدود كننده زمين‌هاي كشاورزي بوده و اثرات نامطلوبي بر رشد و توليد گياهان اعمال مي-كند. اسطوخودوس انگليسي گياهي دارويي و معطر است كه به دليل ارزش اسانس آن از اهميت فوق العاده اي برخوردار است. با توجه به ماهيت نسبتا مقاوم اين گياه به كم آبي، مي تواند جايگزين مناسبي براي گياهان داراي نياز آبي بالا در كشور باشد. به-منظور شناسايي برخي ژن هاي دخيل در پاسخ به خشكي در گياه اسطوخودوس انگليسي، تحليل ترنسكريپتوم اين گياه در شرايط تنش خشكي و شاهد با بكارگيري فناوري RNA-Seq انجام پذيرفت. روش: RNA هاي پيام رسان بافت برگ و گل گياهان شاهد و تحت تنش خشكي توسط Illumina HiSeq. 2000 توالي-يابي شد. ضمن اينكه فعاليت برخي آنزيم هاي آنتي اكسيدان، مالون دآلدئيد و دي تيروزين در گياهان شاهد و تحت تنش اندازه-گيري شد. يافته ها: از مجموع 264126 رونوشت توالي يابي شده، 1083 ژن در بافت گل و 150 ژن در بافت برگ در اثر اعمال تنش خشكي نسبت به گياهان شاهد بيان افتراقي داشتند. چندين گروه GO شامل فعاليت كاتاليتيكي، پاسخ به محرك ها و اتصال، در ژن هاي داراي بيان افتراقي غني شدند. همچنين آناليز KEGG، مسير هاي مختلف مرتبط با تنش مثل سنتز متابوليت هاي ثانويه، متابوليسم گلوتاتيون و پرولين و انتقال سيگنال هورموني را شناسايي نمود. ضمن اينكه برخي ژن هاي مرتبط با آنزيم هاي آنتي اكسيدانت در اين تحقيق شناسايي شد. نتيجه گيري: مطالعه حاضر اولين گزارش از كاربرد RNA-Seq در گياه اسطوخودوس انگليسي تحت تنش خشكي است. تحليل بيوشيميايي صورت گرفته در اين تحقيق نيز با نتايج به دست آمده از RNA-Seq مطابقت داشته است. يافته هاي حاصل از اين تحقيق درك ما را از شبكه مولكولي پاسخ دهنده به تنش خشكي در گياه اسطوخودوس انگليسي توسعه داده است.