كارآيي روش‌هاي استخراج RNA از برگ گياه دارويي سرخارگل

Efficiency of RNA extraction methods from coneflower medicinal plant

سرخارگل گياه دارويي ارزشمند حاوي سطوح بالايي از متابوليت­هاي ثانويه مي­باشد كه تا كنون روش مناسبي جهت استخراج RNA كل از آن معرفي نشده است. در پژوهش حاضر چهار روش استخراج RNA شامل روش ليتيم كلرايد، كيت RNAX-Plus، فنل/SDS و ليتيم كلرايد/فنل مورد بررسي قرار گرفت. به منظور تأييد كيفيت و خلوص RNA از روش اسپكتروفتومتري و الكتروفورز روي ژل آگارز 5/1% استفاده شد. نسبت بالاي جذب محلول RNA در طول‌موج 260 نانومتر به طول موج 280 و 230 نانومتر، مشاهده RNA هاي ريبوزمي و عدم مشاهده اسمير روي ژل به عنوان معياري براي تعيين كيفيت نمونه‌ها در نظر گرفته شد. بالاترين كيفيت RNA حاوي 9/2 ميكروگرم بر ميكروليتر در 100 ميلي‌گرم برگ تازه در روش فنل/SDS و كمترين كيفيت RNA حاوي 2/1 ميكروگرم در 100 ميلي‌گرم برگ تازه در روش ليتيم كلرايد/فنل مشاهده شد. بنابراين، روش فنل/SDS به عنوان مناسب­ترين روش براي استخراج RNA برگ گياه سرخارگل معرفي مي­گردد

Coneflower is a valuable medicinal plant containing high levels of secondary metabolites, but no suitable method for extraction of the entire RNA has been introduced yet. In present study, four methods of RNA extraction including lithium chloride, RNAX-Plus kit, phenol/SDS and lithium chloride/phenol were investigated. For confirming the quality and purity of RNA, spectrophotometer and agarose gel electrophoresis of 1.5% were used. The high absorption ratio of RNA solution at a wavelength of 260 nM to 280 and 230 nM, observation of ribosomal RNAs and the lack of smear on the gel were considered as criteria for determining samples quality. The highest and the lowest qualities of RNA contained 2.9 μg/100 mg of fresh leaves by phenol/SDS method and 1/2 μg/100 mg of fresh leaves by lithium chloride/phenol method, respectively. Therefore, phenol/SDS method is introducing as the most suitable method for RNA extraction from coneflower.