بررسي فيلوژني سويه‌هاي سالمونلاي جدا‌شده از نمونه‌هاي باليني بيمارستان‌هاي تهران براساس تعيين توالي ژن 23S rRNA

زمينه و هدف: باكتري سالمونلا يكي از مهم ترين عوامل گاستروانتريت باكتريايي و بيماري هاي ناشي از غذا است. تاكنون بيش از ۲۵۰۰ سرووار از اين جنس شناسايي شده كه اكثر آنها براي انسان بيماري زا هستند. ساختار فيلوژني خانواده انتروباكترياسه براساس توالي ۱۶S rRNA تنوع وسيعي ندارد. بنابراين اين ژن به دليل ميزان توالي بالاي حفاظت شده در ساختار خود، نمي تواند مشكلات طبقه بندي را در گونه هاي نزديك به هم حل كند. به اين منظور براي بررسي سويه هاي سالمونلا، ژن ۲۳S rRNA انتخاب شد كه توانايي تفكيك سويه هاي مرتبط به هم را در سطح زيرگونه دارد. هدف از اين مطالعه بررسي قرابت سويه هاي سالمونلاي باليني با استفاده از توالي ژن ۲۳S rRNA است. مواد و روش كار: DNA نمونه هاي تأييدشده سالمونلا از بيماران با علائم گوارشي، استخراج و توالي ژن ۲۳S rRNA پس از PCR در آنها تعيين شد. درختچه فيلوژني براساس روش Neighborjoining و با نرم افزار MEGA ۵.۰۵ ۵ رسم شد. يافته ها: دو ساختار مارپيچ ۲۵ و ۴۵ در بين اكثر سويه ها با سروتيپ هاي مختلف ديده شد. در سويه هاي سالمونلاي تيفي تنها ساختار مارپيچ ۲۵ و در بقيه سويه ها مارپيچ ۴۵ مشاهده شد. ميزان قرابت سويه هاي سالمونلا براساس توالي ۲۳S rRNA بين ۱۰۰۹۹ درصد بود. نتيجه گيري: نتايج ژن ۲۳S rRNAتمايز بيشتري براي آناليز در سطح زيرگونه و تفريق سروتيپ ها نشان مي دهد. با توجه به تنوع سروتيپ هاي سالمونلا براساس تفاوت آنتي ژن هاي O و H سطحي، لزوم به كارگيري روش هاي نوين مولكولي در اين راستا و جايگزيني آن با روش هاي سنتي ضروري به نظر مي رسد.