آناليز نواحي تكراري چند ناحيه اي (MLVA) به منظور تيپ بندي سويه هاي سودوموناس آئروژينوزاي عامل عفونت ادراري

سابقه و هدف: سودوموناس آئروژينوزا يكي از شايع ترين عوامل عفونت هاي ادراري در بيمارستان ها مي باشد. هدف از اين مطالعه تعيين تيپ تعدادي از جدايه هاي بدست آمده از بيماران به روش MLVA به منظور رسيدن به يك الگوي ژنتيكي مشخص براي دسته بندي آنها مي باشد. مواد و روش ها: در اين مطالعه 70 سويه سودموناس آئروژينوزا از نمونه ادراري بيماران در بيمارستان هاي تهران جمع آوري شد. براي بررسي ژنوتيپي بر اساس روش MLVA، ابتدا از نمونه ها استخراجDNA ژنومي انجام شد. سپس توالي هاي تكراري پشت سرهم (VNTR) موجود در ژنوم باكتري ها كه درون نواحي ژني MS-213، MS-214، MS-215، MS217، MS-222، MS-223، MS-142 و MS-173 قرار داشتند، توسط پرايمرهاي اختصاصي به روش PCR تكثير شدند. پس از اطمينان از تكثير ژن هاي مورد نظر با استفاده از ژل الكتروفورز، ارتباط تكاملي و تيپ بندي آنها با روش MLVA بررسي شد. يافته ها: بعد از الكتروفورز محصول PCR و تعيين تعداد VNTRها، 70 سويه بدست آمده در 39 تيپ دسته بندي شده و نمودار درخت تكاملي ژني رسم گرديد. بر اساس الگوي MST، 70 سويه باليني به 11 كمپلكس كلونال (clonal complex) تقسيم شدند كه اين معيار نشان دهنده فاصله ژنتيكي بر اساس اختلاف در تعداد VNTR در هر يك از گروه ها بود. نتيجه گيري: مطالعه حاضر نشان داد كه MLVA يك روش موثر براي تيپ بندي سويه هاي باليني سودوموناس آئروژينوزا مي باشد. نتايج بدست آمده نشان دهنده پتانسيل بالاي اين روش در تمايز بين سويه هايي كه از نظر فنوتيپي بسيار شبيه به يكديگر بود، مي باشد.