عنوان مقاله :
ارزيابي تنوع ژنتيكي جمعيتهاي گياه Papaver bractaetum Lindl. رشته كوه البرز با استفاده از نشانگرهاي مولكولي SCoT
عنوان به زبان ديگر :
Evaluation of Genetic Diversity of Papaver bracteatum Lindl. Populations in Alborz Mountain Using SCoT Molecular Markers
پديد آورندگان :
شقاقي، جواد دانشگاه شاهد - گروه اصلاح نباتات , كردنائيج، علاءالدين دانشگاه شاهد - دانشكده كشاورزي - گروه به نژادي و بيوتكنولوژي كشاورزي , قادري، اردشير جهاد دانشگاهي كرج - پژوهشكده گياهان دارويي - مركز تحقيقات گياهان دارويي
كليدواژه :
SCoT , تجزيه خوشه اي , تنوع ژنتيكي , Papaver bracteatum Lindl
چكيده فارسي :
مقدمه: خشخاش كبير Papaver bracteatum Lindl. از خانواده شقايقيان است كه حاوي آلكالوئيد مهمي مانند تبائين ميباشد.
هدف: بررسي تنوع ژنتيكي و ساختار جمعيت خشخاش كبير در رويشگاه رشته كوه البرز.
روش بررسي: 36 ژنوتيپ از سه جمعيت خشخاش (12 فرد از هر جمعيت) انتخاب و بعد از استخراج DNA ژنومي به روش دويل و دويل با استفاده از 26 آغازگر نشانگر مولكولي SCoTمورد پايش قرار گرفتند. محتواي تبائين كپسول با استفاده از روش كروماتوگرافي HPLC و مقايسه با منحني استاندارد مورد اندازهگيري قرار گرفت.
نتايج: از مجموع 26 آغازگر، توسط 12 آغازگر 181 نوار قابل امتياز تكثير شد. دامنه و ميانگين شاخص محتواي اطلاعات چندشكل (PIC) به ترتيب برابر 0/233 تا 0/355 و 0/289 بود. شاخص قدرت تفكيك(RP) آغازگرها بين 2/61 تا 6/5 متغير بود. واريانس درون و بين جمعيتها به ترتيب 57 و 43 درصد بود. تجزيه خوشهاي مبتني بر UPGMA، 36 ژنوتيپ را به سه گروه تقسيم و تجزيه به مختصات اصلي (PCoA)نيز آن را تأييد نمود. بيشترين شباهت (0/86) بين جمعيت (پلور- سياهبيشه) و كمترين شباهت (0/76) بين جمعيت (تهم- سياهبيشه) بود. ميان جمعيتها از نظر محتواي تبائين تفاوت وجود داشت. پلور بيشترين و تهم كمترين مقدار تبائين را داشتند.
نتيجهگيري: نتايج نشان داد كه نشانگر مولكولي SCoTقابليت تفكيك جمعيتهاي خشخاش كبير را دارد و ابزاري كارآمد در مطالعه تنوع ژنتيكي و ساختار جمعيتهاي اين گياه ميباشد. همچنين نتايج كلي نشان داد كه توليد متابوليت ثانويه تبائين تحت تأثير عوامل محيطي و ژنتيكي قرار دارد
چكيده لاتين :
Background: Iranin poppy (Papaver bracteatum Lindl.) belongs to Papaveraceae family which has important alkaloids such as thebain.
Objective: Investigation of genetic diversity and population structure of Iranian poppy populations from Alborz Mountains.
Methods: Total DNA from 36 genotypes (12 individuals from each population) were extracted by doyle method. Thebaine of capsules were assayed by High performance liquid chromatography (HPLC) against standard curve of thebaine.
Results: The 12 primers from 26applied SCoT primers amplified 181 scorable bands. Polymorphism Information Contents (PIC) index ranged from 0.233 to 0.335 with 0.289 mean. Resolving Power (RP) index ranged from 2.61 to 6.5. based on AMOVA the variance of within and among population were 57% and 43% respectively. Unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) based clustering grouped 36 genotypes into three main groups that was supported by principal coordinate analyses (PCoA). The highest (0.86) and lowest (0.76) similarity were between Polur, Siahbisheh and Taham, Siahbisheh populations respectively. Also, thebaine content was differences between populations. The maximum and minimum thebaine content was obtained in Polur and Taham population respectively.
Conclusion: The results showed that the SCoT markers can separate the Iranian poppy population and it’s an efficient tool for study of genetic diversity and population structure. Also results clarified considerable genetic diversity among P. bracteatum population in Alboraz mountains. Based on results of phytochemical and genetic study, thebaine production in Iranian poppy is controled by genetic and environment factors.
عنوان نشريه :
گياهان دارويي