ارتباط پلي‌مورفيسم rs10573247 در 3ˈ-UTR ژن HMGA2 با خطر ابتلا به سرطان معده

The association of rs10573247 polymorphism in 3ˈ-UTR of HMGA2 gene with risk of gastric cancer

پروتئين HMGA2 يكي از فاكتورهاي رونويسي تنظيم كننده تكامل و تمايز سلول است. بررسي­ها نشان مي‌دهد كه تغييرهاي بيان ژن HMGA2 مي­تواند نقش مهمي در جلوگيري از پيشرفت تومور و جلوگيري از متاستاز آن داشته باشد. مواد و روش­ها: از نمونه خون 100 فرد مبتلا به سرطان معده و 100 فرد سالم DNA ژنومي استخراج شد. سپس بخشي از ژن HMGA2 كه در برگيرنده پلي­مورفيسم rs10573247 بود با تكنيك PCR تكثير شد. در ادامه محصول PCR با آنزيم محدودالاثرEaR1 تيمار شد و ژنوتيپ هر فرد مشخص گرديد. در نهايت با تست آماري 2χ و رگرسيون لجستيك ارتباط اين واريانت با خطر ابتلا به بيماري سرطان معده بررسي شد. يافته ­ها: بررسي آماري ارتباط آللي و ژنوتيپي پلي­مورفيسم rs10573247 با خطر ابتلا به سرطان معده نشان داد كه ارتباط معناداري بين آلل­هاي مختلف پلي­مورفيسم rs10573247 (127/0P =) و هيچ يك از ژنوتيپ­هاي آن با خطر ابتلا به سرطان معده وجود ندارد. نتيجه­ گيري: عدم ارتباط پلي­مورفيسم rs10573247 در ژن HMGA2 با خطر ابتلا به سرطان معده ارتباطي ندارد كه مي­تواند ناشي از حجم كم نمونه مورد بررسي باشد.

The HMGA2 protein is one of the transcription factors that regulates the evolution and differentiation of the cells. Studies have shown that changes in the expression of the HMGA2 gene can play an important role in preventing tumor progression and its metastasis. In this study, we investigated the association between rs10573247 polymorphism in the 3-UTR region of HMGA2 gene and the risk of gastric cancer. Material and Methods: Genomic DNA from blood sample of 100 patients with gastric cancer and 100 healthy individuals were extracted A part of the HMGA2 gene, including rs10573247 polymorphism, was amplified by PCR technique. After, the PCR product was treated with EaR1 enzyme and the genotype of each individual was determined. Finally, the risk of gastric cancer was assessed with the statistical tests of χ2 and logistic regression. Results: The statistical analysis of allelic and genotypic association of rs10573247 polymorphism with the risk of gastric cancer showed that there was not significant relationship between different alleles of rs10573247 polymorphism (P = 0.127) and none of its genotypes with gastric cancer risk. Conclusion: It seems none of the rs10573247 polymorphism genotypes in the HMGA2 gene were associated with the risk of gastric cancer.