شناسايي همزمان 3 فاكتور ويرولانس kpsMTII، iucD و usp در اشريشيا كلي ايجاد كننده عفونت دستگاه ادراري با روش Multiplex-PCR

Identification of 3 Virulence Factors kpsMTII, iucD‚ usp in Urinary Tract Infection E. coli by Multiplex-PCR

سابقه و هدف: باكتري اشريشياكلي (E. coli) فلور طبيعي در روده طبيعي انسان و حيوانات است. اين باكتري يكي از عوامل اصلي عفونت ادراري است. هدف از اين مطالعه شناسايي و بررسي حضور هم­زمان 3 فاكتور بيماري­زاي kpsMTII، iucD و usp در ژنوم سويه­ هاي باكتري اشريشياكلي ايجاد كننده عفونت ادراري بود. مواد و روش ­ها: 60 نمونه باكتري اشريشياكلي ايجاد كننده عفونت ادراري جمع­ آوري گرديد. باكتري­هاي مورد نظر با تست­هاي بيوشيميايي و رنگ ­آميزي گرم شناسايي شدند. ژنوم باكتري از طريق كيت­هاي جداسازي DNA باكتري گرم منفي جداسازي شد. سپس براي حضور هم­زمان 3 عامل بيماري­زايي مورد نظر از روش Multiplex-PCR استفاده شد. يافته­ ها: در اين 60 نمونه باكتري اشريشياكلي جداسازي شده، حضور ژن­هاي بيماري­زا، kpsMTII 66/71 درصد، iucD 33/88 درصد، usp 66/36 درصد بود و هم­چنين حضور هم­زمان 3 فاكتور در 33/28 درصد نمونه­ها مشاهده شد. بين فراواني حضور اين سه ژن با ايجاد عفونت ادراري در نمونه­ هاي اشريشياكلي مورد بررسي ارتباط معني­داري وجود داشت (05/0 Pvalue< ). نتيجه ­گيري: بر اساس نتايج اين تحقيق، مشابه با مطالعه­ هاي پيشين، بين حضور اين سه ژن بيماري زا در نمونه­ هاي مورد مطالعه از باكتري اشريشياكلي ايجاد كننده عفونت ادراري مي­تواند ارتباط معني­دار وجود داشته باشد.

E. coli is a normal flura in the human and animal intestinal tract. This bacteria is one of the main cause of the urinary tract infection. The aim of this study was identification and simultaneously presence of 3 virulence factors, kpsMTII, iucD, usp in the genome of urinary tract infection E. coli strains. Materials and Methods: 60 samples of E. coli, which caused urinary tract infection, were collected. These bacteria were isolated by biochemical tests and gram staining. Then bacteria genome was extracted by gram-negative bacteria DNA extraction kits. Multiplex-PCR was used for identifying of 3 virulence factors. Results: In these 60 samples of isolated E. coli, the prevalence of virulence genes is as follows: kpsMTII 71.66%, iucD 88.33%, and usp 36.66%. As also, simultaneously presence of 3 virulence factors were observed in 28.33% of samples. There was significant association between prevalence of these three genes and urinary tract infection in studied E. coli isolates (Pvalue<0.05). Conclusion: According to this study results, that was similar to previous researches, could be significant related between prevalence of these three genes in studied urinary tract infection E. coli samples