عنوان مقاله :
شناسايي هاپلوگروه هاي مادري جمعيت اسب هاي استان اردبيل با استفاده از ناحيه كنترل ژنوم ميتوكندريايي
عنوان به زبان ديگر :
Maternal Haplogroup identification of horse population in Ardabil province using mitochondrial control region
پديد آورندگان :
عمري كولانكوه مصطفي دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي , هدايت ايوريق نعمت دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي , بوستان آزاده دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي , سيد شريفي رضا دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي , واحدي وحيد دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي , خلخالي ايوريق رضا دانشگاه محقق اردبيلي - دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي - گروه علوم دامي
كليدواژه :
اسب بومي , هاپلوتيپ , تنوع نوكلئوتيدي و تنوع ژنتيكي , ژنوم ميتوكندريايي
چكيده فارسي :
حفظ نژادهاي بومي از اهداف مهم اصلاح نزادي محسوب مي‌شود و جهت شناسايي ساختار ژنتيكي جمعيت باقي مانده اساس حفظ نژادي است. لذا اين پژوهش با هدف بررسي ساختار ژنتيكي اسب هاي استان اردبيل و مقايسه با ديگر نژادهاي خارجي با استفاده از ناحيه كنترل (d-loop) ژنوم ميتوكندريايي انجام گرفت. جهت انجام آزمايش dna ژنومي استخراج و مستقيماً پس از تكثير 430 جفت بازي از ناحيه كنترل با استفاده از روش سنگر از 100 راس اسب بومي مربوط به استان اردبيل توالي يابي گرديد. آناليز توالي‌ها منجر به شناسايي 43 جايگاه چندشكلي شد كه منجر به ايجاد 40 هاپلوتيپ مختلف گرديد كه براساس هاپلوگروه هاي شناسايي شده در 9 هاپلوگروه (a،b ،c ، g ،i ،l ،m ،p و q) قرار گرفتند. مقدار تنوع نوكلئوتيدي، تنوع هاپلوتيپ و dتاجيما در اسب هاي بومي استان اردبيل به ترتيب 0/02412، 0/877 و 0/571 به دست آمد. ميزان d تاجيما انحراف معني‌داري را نشان نداد. نتايج اين مطالعه نشان داد كه خط مادري در اسب هاي اردبيل از تنوع بالايي برخوردار است.
چكيده لاتين :
Conservation of indigenous animal is one of the main goals of animal breeding and identification of genetic structure of population is the basis for breed conservation. The aim of this study was to evaluate the genetic structure and the genetic relationship between native horses’ in Ardabil Province using mitochondrial D-loop region. Blood samples were collected from 100 horses. Total DNA was extracted and 430 bp of D-Loop region (hyper variable) were amplified and sequenced using Sanger sequencing method. The analysis of data led to identify 48 polymorphic sites that create 52 haplotypes. The plotted phylogenic tree for haplotypes of Iranian native horses is placed in the 9 haplogroups including A, B, C, G, I, L, M, P and Q. Genetic and haplotype diversity values were 0.0241 and 0.877, respectively. Tajima D was calculated -0.571 which was not significant (p>0.1). Results of this study indicated that the maternal line of Ardabil horses had high genetic diversity.
عنوان نشريه :
محيط زيست جانوري
