بررسي تنوع ژنتيكي جمعيت اسب كرد ايران با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره

Study of Genetic variation in Iranian Kurdish horse using microsatellite marker

در اين تحقيق با استفاده از شش نشانگر ريزماهواره (HMS07, HMS03, HMS02, HMS06, ASB02, ASB23) تنوع ژنتيكي درون جمعيت 52 نمونه اسب كرد اصيل كه از استان­ هاي كردستان، كرمانشاه، ايلام، آذربايجان غربي، اصفهان، كرمان و همدان به‌طور تصادفي نمونه‌گيري شده‌اند، بررسي شد. از نمونۀ خون­ هاي گرفته‌شده DNA به روش نمكي بهينه يافته استخراج شد. واكنش زنجيره‌اي پليمراز (PCR) براي افزونش قطعه‌هاي شش جايگاه ريزماهواره با استفاده از جفت آغازگرهاي اختصاصي به‌صورت استاندارد انجام شد. آنگاه محصولات PCR شش جايگاه روي ژل اكريل آميد 8 درصد، الكتروفورز و رنگ‌آميزي شد. جايگاه­ ها در جمعيت مورد بررسي، چندشكلي بالايي را نشان دادند. شمار آلل­ هاي مشاهده‌شده و آلل­ هاي مؤثر و ميزان ناخالصي (هتروزيگوسيتي) مورد انتظار و مشاهده‌شده و شاخص شانون براي همۀ جايگاه ­ها محاسبه شد. نتايج اين تحقيق نشان داد، شمار آلل­ هاي شش جايگاه مورد بررسي، از 4 تا 10 آلل متغير بودند. بيشترين آلل در جايگاه HMS07 (ده آلل) و كمترين آلل در جايگاه HMS02 (چهار آلل) مشاهده شد. با توجه به نتايج مشاهده‌شده، جايگاه­ هاي ريزماهوارۀ مورد استفاده چندشكلي بالايي در جمعيت اسب كرد داشتند و مي‌توان از چندشكلي بالاي آن‌ها در بررسي‌هاي بعدي، به‌ويژه در بررسي‌هاي ژنتيك جمعيت استفاده كرد. آلل ­ها و دامنه­ هاي آللي جديد در اسب كرد، گوياي تفاوت ساختاري جمعيتي آن‌ها با ديگر نژادهاي اسب مورد بررسي در تحقيقات ديگر مانند اسب تركمن و عرب است.

In this research genetic variation using 6 microsatellite loci (HMS07, HMS03, HMS02, HMS06, ASB02, ASB23) was studied in Iranian Kurdish horse population .Whole blood samples were randomly collected from 52 horses in Kurdistan, Kermanshah, Elam, Western Azerbaijan, Esfahan, Kerman and Hamadan regions. DNA was extracted from blood samples. Polymerase chain reaction (PCR) was used for amplification of 6 microsatellite loci using pairs of standard specific primers. Then, the PCR products assessed with 8% silver-staining acrylamide gel and electrophoresed. All microsatellites loci were polymorphic. The number of alleles observed and expected hetrozygosities were calculated with Shannon Index. The largest and smallest number of alleles were observed in HMS07 locus (10 alleles) and HMS02 (4 alleles) respectively. Our results confirmed the high efficiency of microsatellite markers for assessing population structure in Iranian native horses.