طراحي روش جديد محاسبه‌ي پهناي متوسط لاين در تصاوير پالس فيلد ژل الكتروفورز جهت آشكارسازي و استخراج لاين

مقدمه: مقاله‌ي حاضر روش جديدي را براي محاسبه‌ي پهناي متوسط لاين در تصاوير پالس فيلد ژل الكتروفورز (Pulsed field gel electrophoresis يا PFGE) جهت آشكارسازي و استخراج لاين‌ها نشان داد. اگرچه مطالعاتي پيرامون آشكارسازي لاين‌ها بر اساس پروجكشن- پروفايل ‏(‏Projection profiles‏) ‏گزارش شده، اما هنوز يك روش اتوماتيك با خطاي كم انجام نگرفته است. پهناي متوسط لاين، مهم‌ترين پارامتر براي انجام اتوماتيك پردازش تصاوير PFGE مي‌باشد. اين پژوهش با هدف استفاده از روش چگالي طيف توان براي محاسبه‌ي پهناي متوسط لاين انجام شد. روش‌ها: ابتدا بر اساس چگالي طيف توان، پردازش تصاوير PFGE انجام گرديد. الگوريتم پيشنهادي با استفاده از 10 تصوير PFGE بهبود داده شد و سپس براي تست از 20 تصوير ديگر استفاده گرديد كه در مجموع شامل 300 لاين بود. تصاوير با استفاده از دستگاه ژل الكتروفورز ميدان پالسي مدل Bio-Rad واقع در آزمايشگاه ميكروب‌شناسي دانشگاه علوم پزشكي كرمانشاه تهيه شد. يافته‌ها: استفاده از روش چگالي طيف توان در مقايسه با روش تقاطع خط افقي، 99/6 درصد از خطاي آشكارسازي مراكز لاين را كاهش مي‌دهد. نتيجه‌گيري: با توجه به اين ‌كه پارامتر پهناي متوسط لاين در چندين مرحله براي آشكارسازي و استخراج لاين‌ها مورد استفاده قرار گرفت، استفاده از روش چگالي طيف توان مي‌تواند فرايند استخراج لاين را بهبود بخشد.