شناسايي ژن هاي ميتوكندريايي تأثير گذار بر تكامل سلول تخم تحت هورمون FSH با استفاده از داده هاي ريز آرايه در گاو

بلوغ تخمك شامل بلوغ هسته اي و سيتوپلاسمي است كه هر دو براي لقاح و نمو رويان اهميت دارد. برخلاف بلوغ هسته اي، بلوغ سيتوپلاسمي اووسيت را نمي توان به راحتي ارزيابي كرد. با توجه به توزيع مجدد برخي اندامك ها از جمله ميتوكندري در زمان بلوغ مي توان آن را به عنوان شاخص بلوغ سيتوپلاسمي در نظر گرفت. در اين مطالعه به منظور بررسي اثر هورمون FSH در شرايط آزمايشگاهي بر چگونگي بيان ژن هاي ميتوكندريايي، داده هاي ريزآرايه حاوي اطلاعات بيان ژن سلول هاي اووسيت گاو، با كد دسترسي GEO ( (GSE38345 استفاده گرديد. آناليز و مقايسه بيان ژن ها در دو حالت قبل و بعد از بلوغ به ترتيب (20 و 96 ساعت بعد از تيمار) با استفاده از لينك نرم افزاري GEO2R، دو گروه ژن هاي افزايش و كاهش بيان يافته را تعيين نمود. برهمكنش گروه هاي ژني با استفاده از پايگاه اطلاعاتي string، مجسم سازي شبكه با استفاده از نرم افزار cytoscape و هستي شناسي شبكه با استفاده از پايگاه اطلاعاتي comparative GO انجام گرديد. در شبكه برهمكنش پروتئيني مربوط به ژن هاي افزايش بيان يافته، ژن هاي مهمMRPS10 ، MRPS18A، MRPL16 و MRPL17 كه در فرايند هاي انهدام ميتوكندري و ترجمه ژن هاي اين اندامك و در شبكه ژن هاي كاهش بيان يافته، ژن هايMRPL22، ATP5Bو ATP5C1كه با كاهش بيان خود، سعي در ايجاد تعادل در مسير هاي مرتبط با انهدام ميتوكندري و توليد ATP از طريق نقش در ساختار ATP سنتتاز، داشتند. در اين مطالعه ژن هاي تنظيم كننده و همچنين مسير هاي بيولوژيكي مؤثر به منظور درك ساز و كار اثر هورمون FSH بر روند بلوغ اووسيت از طريق اندامك ميتوكندري بررسي گرديده است.