طراحي پروتئين نوتركيب حاوي اپي توپ هاي محافظت شده آنتي‌ژن هماگلوتينين ويروس آنفولانزاي سويه هاي H1N1 و H5N1 با استفاده از روش‌هاي بيوانفورماتيك

مقدمه: درسال هاي اخير و با توجه به پيشرفت هاي انجام شده درحوزه بيوانفورماتيك، طراحي واكسن آنفولانزا دستخوش پيشرفت هاي قابل ملاحظه اي شده است. هدف از اين مطالعه طراحي يك پروتئين نوتركيب چندظرفيتي برمبناي اپي توپ بسيار محافظت شده پروتئين هماگلوتينين سويه‌هاي H1N1 و H5N1 است كه در طي زمان دچار تغيير و موتاسيون نمي شوند. روش كار: براي اين منظور و با توجه به مطالعات ميداني قبلي توالي سويه‌هاي مورد نظر بررسي شد و اپي‌توپ‌هايي از اين سويه‌ها انتخاب شدند.پس از بررسي خصوصيات ايمني زائي و شيميائي اپي توپ هاي انتخاب شده توسط سرور هاي مناسب،‌ ساختاراوليه پروتئين نوتركيب تعيين شد و متعاقب ترجمه معكوس توالي فوق ، بهينه‌سازي كدون انجام شد و در نهايت توالي بهينه شده در درون وكتور PET32a+ و دربين دو ناحيه آنزيمي BamHI/XhoI قرارداده شد. نتايج: نتايج بدست آمده نشان داد كه پروتئين نوتركيب حاصله دراين مطالعه داراي وزن ملكولي 22451.72 g/mol با 214 اسيد آمينه مي باشد. pH ايزوالكتريك پروتئين فوق 7.25 و ميزان حلاليت آن درسيستم پروكاريوتي 100 درصد است. ضريب خاموشي ساختار فوق نيز به ميزان M^-1cm^-1 60170 تعيين شد. در نهايت و پس ازبهينه سازي كدون، شاخص انطباق كدون ( CAI)پروتئين نيز به ميزان 0.95محاسبه گرديد.نتيجه‌گيري: در نهايت وباتوجه به داده‌هاي فوق پيش‌بيني مي‌شود كه ساختار چند اپي توپي طراحي شده دراين مطالعه كه داراي خصوصيات ايمونولوژيكي منحصر بفرد و قابل قبولي است را مي‌توان با موفقيت و به ميزان قابل قبولي درسيستم پروكاريوتي بيان نمود و جهت مطالعات ايمني زائي برعليه ويروس آنفولانزاي A مورداستفاده قرار داد.