ارزيابي جامع بيوانفورماتيكي بيان ترشحي هورمون رشد انساني با توالي‌هاي راهنماي مناسب در Escherichia coli: مطالعه In Silico

مقدمه: امروزه، مهندسي ژنتيك و بيوانفورماتيك، توليد انبوه پروتئين‌هاي نوتركيب دارويي در باكتري Escherichia coli را كه داراي ويژگي‌هاي منحصر به فرد بياني است، به امري معمول و اقتصادي تبديل كرده است. در اين ارزيابي بيوانفورماتيكي، توليد پري‌پلاسميك هورمون رشد انساني بررسي گرديد. هدف از انجام اين تحقيق، ارزيابي جامع بيوانفورماتيكي 48 توالي راهنماي انساني توسط پايگاه‌هاي داده‌ي معتبر به منظور بررسي بيان پروتئين نوتركيب هورمون رشد انساني در ميزبان Escherichia coli بود.روش‌ها: با استفاده از پايگاه داده‌ي قدرتمند SignalP نسخه‌ي 4.1، صحت و دقت جايگاه برش تعداد 48 توالي‌ راهنما ارزيابي و گزينش شدند. خصوصيات فيزيكوشيميايي توالي راهنماي باقي‌مانده، توسط پايگاه‌هاي داده‌ي‌ Genescript و Protparam مورد بررسي قرار گرفتند. قابليت حل شدن پروتئين، فعاليت ترشحي پس از بيان و ساز و كار انتقال توالي‌هاي راهنما توسط پايگاه‌هاي داده‌ي Solpro، ProtCompB و PREDTAT، بررسي شدند.يافته‌ها: بر اساس نتايج به دست آمده به صورت تئوري، توالي‌هاي راهنماي مناسب براي اتصال به پروتئين هورمون رشد انساني به ترتيب فسفوپروتئين بزاقي غني شده با پرولين (Proline rich protein HaeIII subfamily 1 يا PRH1)، پروتئين ترشح شده‌ي C10orf99 و پپتيد رها كننده‌ي پرولاكتين (Prolactinreleasing hormone يا PRLH) پيش‌بيني شد.نتيجه‌گيري: بيان ترشحي، مزايايي را در مقابل بيان سيتوپلاسميك ايجاد مي‌كند. نتايج اين تحقيق، نشان داد كه با بررسي توالي‌هاي راهنماي مختلف در اتصال با پروتئين هورمون رشد انساني، دستيابي به توالي‌هاي داراي پتانسيل و قابليت بيان ترشحي بهتر امكان پذير شده است. لازم است در مطالعات آتي صحت اين نتايج بررسي گردد.