عنوان مقاله :
PCR-DGGE : روشي نوين در دنياي ميكروبيولوژي
عنوان به زبان ديگر :
PCR-DGGE: a new technique in the world of microbiology
پديد آورندگان :
توكلي، آروين دانشگاه الزهرا - دانشكده علوم پايه - گروه زيست شناسي، تهران
كليدواژه :
تكنيك هاي مولكولي , ميكروبيولوژي , PCR-DGGE
چكيده فارسي :
PCR-DGGE يكي از روشهاي مولكولي نوين مي باشد كه در ابتدا براي كشف پلي مورفيسم DNA ابداع شد. اين تكنيك قطعات هم اندازهDNA را بر اساس اختلاف توالي جدا مي كند. در حال حاضر اين تكنيك در حوزه هاي مختلف علم ميكروبيولوژي مانند ميكروبيولوژي پزشكي، ميكروبيولوژي غذايي و ميكروبيولوژي صنعتي به كار مي رود. در اين روش پس از استخراج DNA از نمونه مورد نظر، DNA به كمك پرايمرهاي يونيورسال از طريق PCR تكثير مي شود. سپس محصول PCR كه حاوي قطعات هم اندازه ي DNA ميباشد، بر روي ژل DGGE كه حاوي شيبي از مواد دناتوره كننده (اوره و فرم آميد) است، قرار ميگيرد و الكتروفورز انجام مي شود DGGE . DNA ي باكتريهاي مختلف را تفكيك مي كند كه مي توانند براي آناليز هاي بعدي مورد استفاده قرار گيرند. علي رغم وجود برخي محدوديت ها مانند محدوديت در سايز توالي مورد استفاده، PCR-DGGE ميتواند به عنوان يك تكنيك سريع و كارآمد براي اهداف بسياري در ميكروبيولوژي مورد استفاده قرار گيرد. در اين مطالعه ضمن معرفي اجمالي اين تكنيك، مزايا و محدوديت هاي آنرا در تحقيقات ميكروبيولوژي مورد بررسي قرار مي دهيم.
چكيده لاتين :
PCR-DGGE is one of the newest molecular methods. This technique separates co-size DNA fragments based on sequence differences and was originally devised to discover DNA polymorphism. PCR-DGGE uses in different fields of microbiology Such as medical microbiology, food microbiology and industrial microbiology. In this method, after DNA extraction from the specimen, DNA is amplified by universal primers through PCR. Subsequently, the PCR is loaded on the DGGE gel containing denaturing gradient of urea and formamide and the electrophoresis is performed. The DGGE separates the DNA fragments that belong to different bacteria, which can be used for further analysis. Despite of some limitation such as length limit of considered DNA fragment, the PCR-DGGE technique can be used as a fast and efficient technique for many purposes in microbiology. In this study, following the introducing of PCR-DGGE method, we are going to investigate the advantages and limitations of this technique in microbiological research.
عنوان نشريه :
بيولوژي كاربردي
