غربالگري اثربخشي مهاركننده هاي پروتئاز اچ-آي-وي روي پروتئاز كوويد-19

Screening Efficacy of Available HIV Protease Inhibitors on COVID-19 Protease

زمينه و هدف: ظهور كوويد-19 نياز به يافتن دارو جهت درمان آن را مورد توجه محققان قرار داد. گذشته از تلاش براي طراحي داروهاي جديد، غربالگري داروهاي موجود براي بررسي اثربخشي آنها روي كوييد-19 ميتواند راهكاري سريعتر جهت آغاز دارودرماني باشيد. در اين تحقيق اثربخشي مهاركنندههاي پروتئاز اچ-آي-وي روي پروتئاز كوويد-19 مورد ارزيابي قرار مي‌گيرد. روشها: غربالگري به روش داكينگ مولكولي با نرم افزار اتوداك جهت ارزيابي اثربخشي برهمكنش‌هاي ليگاند-گيرنده انجام ميشود. يافته‌ها: نتايج مربوط به انرژي پيوندي، ثابت مهاري و كيفيت برهمكنشها، مناسب بودن ايده تحقيق در اثربخشي مهاركنندههاي موجود پروتئاز اچ-آي-وي روي پروتئاز كوويد-19 را نشان دادند. نتيجه‌گيري: نتايج كمي نشان دهنده اثربخشي‌هاي متفاوت اين ليگاندها در مقايسه با يكديگر براي فعاليت مهاركنندگي كوويد-19 بودند و نتايج كيفي نيز از قرارگيري متنوع ليگاندها نسبت به جايگاه فعال پيشنهاد شده پروتئاز حكايت داشتند. ماحصل نتايج اين تحقيق معرفي كردن Nelfinavir به عنوان بهترين ليگاند از حيث كمي و هر كدام از Saquinavir، Amprenavir و Fosamprenavir به عنوان بهترين ليگاند از حيث كيفي با اثربخشي مهاري احتمالي روي پروتئاز كوويد-19 است

Background and Aim: Advent of COVID-19 attracted the attentions of researchers to develop drugs for its treatment. Besides efforts on developing new drugs, screening available drugs to see their efficacy on COVID-19 could be an urgent action of initiating its pharmacotherapy. In this study, efficacy of HIV protease inhibitors on COVID-19 protease has been examined. Methods: Molecular docking based screening by AutoDock software has been done to examine the efficacy of ligand-receptor interactions. Results: Obtained results of binding energy, inhibitory constant and interactions quality have approved the idea of efficacy of HIV protease inhibitors on COVID-19 protease. Conclusion: Quantitative results indicated different levels of efficacy of investigated ligands for inhibitory activity of COVID-19 and qualitative results indicated various localizations of ligands in the proposed active site of protease. The concluding remarks of this study are to introduce Nelfinavir as the best ligand in quantitative respect and each of Saquinavir, Amprenavir and Fosamprenavir as the best ligands inqualitative respect for possible inhibitory effects on COVID-19 protease.