پردازش جهش ژن ( S (HBs Agدر مبتلايان به هپاتيت B مزمن و تعيين الگوي فرار ايمني اكتسابي آن‌ها

Analysis of S gene (HBs Ag) mutation in chronic hepatitis B patients and determination of their acquired immune escape pattern

مقدمه: سويه­ هاي جهش يافته مقاوم به آنالوگ­هاي نوكلئوزيدي/نوكلئوتيدي ويروس هپاتيت B (HBV) در نتيجه طولاني شدن زمان مصرف و بروز پليمرفيسم تك نوكلئوتيدي (SNP) و جهش­ هاي گريز پديدار مي­شوند. هدف از مطالعه حاضر، شناسايي فشارهاي انتخابي و جهش فرار ايمني در ژن HBsAg (S) در بيماران مبتلا به HBV مزمن است. روش كار: در اين مطالعه مقطعي كه در سال 1397 در شهر كرج انجام شد، پنجاه بيمار مبتلا به هپاتيت B مزمن در دو گروه تحت درمان و بدون درمان دسته­ بندي شدند. تعداد كپي­ هاي DNA ويروس هر بيمار با real time PCR برآورد شده و توالي ژن S تعيين شد. اثر هر SNP بر پايداري پروتئين S با I-mutant و برآورد ميزان انرژي آزاد DDG پيش بيني شد. نتايج: كمترين ميزان بار ويروس و بيشترين آن به ترتيب 101 × 1/1 و ml/108 × 3/4 كپي برآورد شد. بيشترين تعداد جهش منجر به تغيير شامل Q101R، T115N، S143L، و Q129P در يك فرد با سابقه مصرف دارو تعيين شد. در يك بيمار بدون درمان، جهش هاي M133T و L175S مشاهده شد. جهش Q129P، S174N و Y134C نيز در افراد ديگر با سابقه درمان مشاهده شد. از مجموع 8 تغيير اسيد آمينه، L175S با DDG برابر با Kcal/mol 87/1- بيشترين اثر كاهشي را بر پايداري پروتئين S داشت. نتيجه گيري: براساس اين دادهها، بين SNP ژن S ويروس و پيدايش جهش گريز ارتباط وجود دارد. يافته ­هاي بررسي­ هاي جهش‌هاي گريز ميتواند بر بهبود درمان و ايمن سازي عليه عفونت مزمن هپاتيت B اثر گذار باشد.

Background: Mutant strains resistant to nucleoside/nucleotide analogs of hepatitis B virus (HBV) emerge due to the prolonged usage and single nucleotide polymorphism (SNP) incidence and escape mutations. The current study aimed to detect the selective pressures and the immune-associated escape mutation in HBsAg (S) gene in chronically HBV-infected patients. Materials and Methods: In this cross-sectional study in 2013, fifty patients with chronic hepatitis B in Karaj were divided into treated and untreated groups. The number of virus DNA copies was quantified by real-time PCR and S gene was sequenced. The effect of each SNP on S protein stability was predicted with 1-mutant and DDG free energy estimation. Results: The lowest and the highest viral load in the serum samples were estimated 1.1 × 101/ml and 4.3 × 108/ml copies, respectively. The highest number of mutations leading to amino acid substitution includes Q101R, T115N, S143L, and Q129P was determined in one person who used drug was identified. In one patient without treatment, the M133T and L175S mutations were observed. The Q129P, S174N, and Y134C were also seen in others with a history of treatment. Of the 8 amino acid changes, L175S with DDG equal to 1.87 Kcal/mol had the greatest reduction effect on S protein stability. Conclusion: According to these data, there is a relationship between the SNP of the virus S gene and the emergence of escape mutations. Findings of studies of escape mutations in human populations can influence the improvement of treatment and immunization against chronic hepatitis B infection.