بررسي كارايي روش‌هاي مختلف استخراج آر.ان.آ در شناسايي ويروس موزاييك كدو (Squash mosaic virus)

تخريب اسيد نوكلئيك در طي فرآيند استخراج آن از بافت گياهي و نيز وجود مواد بازدارنده از عمده‌ترين معضلات خالص‌سازي ژنوم ويروس‌هاي گياهي است. به منظور رديابي موثر ويروس موزاييك كدو از بافت خربزه از مزارع آلوده، چهار روش مختلف استخراج RNA با يكديگر مقايسه و روش استخراج اسيدنوكلئيك از اين گياه بهينه شد. كيفيت اسيدنوكلئيك استخراج شده به وسيله آزمون زنجيره‌اي پلي‌مراز با نسخه‌برداري معكوس و به كمك دو جفت آغازگر متفاوت تعيين شد. در بين روش‌هاي استخراج تفاوت چشمگيري وجود داشت به نحوي‌كه بعضي از روش‌ها قادر به رديابي ويروس از بافت گياهي نبودند. در بين روش‌هاي مورد مقايسه، روش استخراج dsRNA با سلولز به علت خالص‌سازي انحصاري اسيدنوكلئيك ويروسي از بافت گياه، بيشترين و بهترين اسيدنوكلئيك را در پي داشت و رديابي ويروس در اغلب نمونه‌ها را ممكن مي‌نمود.