شناسايي ژن‌ها و ميكرو RNAهاي كليدي درگير در مسير آپوپتوزيس عقرب Androctonus crassicauda

رخداد مرگ سلولي برنامه ريزي شده يا آپوپتوزيس به‌عنوان روش حفاظت شده، تحت كنترل تعدادي ژن قرار دارد كه جهت حذف سلول‌هاي غير ضروري بكار مي‌رود. اين رويداد سلولي در سيستم‌هاي مرتبط با ايمني و بيماري دخيل است. آپوپتوزيس يك مكانيسم تنظيم‌گر سلولي است كه اثرات تكثير سلولي و مرگ سلولي را متعادل مي‌كند. در مسير آپوپتوزيس، ژن‌ها و مولكول‌هاي فراواني درگير هستند. اخيرا گسترش توليد داده‌ها با استفاده از تكنيك RNAseq نشان داده كه ميكرو‌RNAها، نقش مهمي در تنظيم مرگ سلولي برنامه ريزي شده يا آپوپتوزيس بازي مي‌كنند. هدف از اين مطالعه شناسايي ژن‌ها و ميكروRNAي كليدي موثر در مسير آپوپتوزيس در عقرب‌هاي آندروكتونوس كراسيكودا بود. مواد و روش‌ها: در اين پژوهش پس از توالي‌يابي ترانسكريپتوم غده زهر عقرب‌هاي اندوروكتونوس كراسيكودا با استفاده از پلتفرم ايلومينا 2000 Hiseq و پيكربندي ترانسكريپتوم با استفاده از نرم‌افزار Trinity، مهم‌ترين پروتئين‌هاي ترانسكريپتوم غده زهر عقرب دخيل در آپوپتوزيس با استفاده از پايگاه اطلاعاتي KEGG شناسايي شدند. رسم شبكه ژني آپوپتوزيس با نرم افزار استرينگ، تجزيه و تحليل شبكه برهمكنش پروتئيني با استفاده از نرم‌افزار سايتواسكيپ و بررسي هستي شناسي ژن‌هاي كليدي به وسيله پايگاه WebGestalt صورت گرفت. علاوه‌بر‌آن پس از شناسايي ميكرو‌RNAهاي عقرب با استفاده از جستجوي همساني، پيش‌بيني ژن‌هاي هدف و رسم شبكه ميانكنش پروتئين-ميكروRNA توسط برنامه‌هاي miRTarBase, TarBase ,miRecords و نرم افزار miRNet انجام گرفت. نتايج: سه مسير مرتبط با آپوپتوزيس شناسايي شدند كه ۱۰۳ پروتئين از آن‌ها استخراج شدند. نتايج به دست آمده از آناليز شبكه برهمكنش پروتئيني منجر به شناسايي 30 ژن كليدي دخيل در بروز آپوپتوزيس شد كه بر اساس نتايج بدست آمده، موثرترين ژن‌هاي كليدي درگير در بروز آپوپتوزيس Akt1،bsk ، Jra، Dronc و rl هستند. نتايج تجزيه و تحليل آماري شبكه برهمكنش پروتئين-ميكروRNA نيز نشان داد كه ميكروRNAي mir-7-5p بيش‌ترين ارزش را درا مي‌باشد. نتيجه‌گيري: نتايج اين بررسي نشان داد كه ميكروRNAها در تنظيم بسياري از ژن‌هاي مسير آپوپتوزيس نقش اساسي ايفا مي‌كنند و مي‌توان براي كنترل بيان ژن‌ها از آن‌ها كمك گرفت.