شناسايي بيوانفورماتيكي و بررسي بيان miRNA هاي دخيل در نمو دانه ارقام گندم ايراني با كيفيت نانوايي متفاوت

كيفيت نانوايي گندم (Triticum aestivum L.) به شدت وابسته به حضور و تركيب پروتئين هاي گلوتن در دانه است. در اين مطالعه، كيفيت نانوايي چهار رقم گندم ايراني (مرواريد، سرداري، پارسي و سپاهان) بر اساس آناليزهاي فارينوگرافي و شيميايي آرد و حجم ويژه نان به ترتيب از بيش ترين به كم ترين كيفيت رتبه بندي شد. به منظور شناسايي و مقايسه miRNA هاي دخيل در نمو دانه بين گندم هاي ايراني با كيفيت نانوايي خوب و ضعيف، داده هاي RNAseq هفت رقم گندم (چهار رقم با كيفيت خوب و سه رقم با كيفيت ضعيف) در دو مرحله نموي دانه از پايگاه اطلاعاتي NCBI پياده سازي و آناليز شدند. از miRNA هاي شناسايي شده، پنج miRNA حفاظت شده انتخاب و الگوي بيان آن ها با استفاده از روش Real Time PCR در دو مرحله نموي دانه (10 و 20 روز پس از گرده افشاني) در چهار رقم گندم  ايراني بررسي شد. نتايج نشان داد كه الگوي بيان miR159a، miR164a، miR172a و miR827a طي نمو دانه در همه ارقام مورد بررسي روند افزايشي داشت، در حالي كه الگوي بيان miR396c روندي كاهشي نشان داد. miR164a و miR396c بيش ترين و كم ترين بيان نسبي را به ترتيب در ارقام سپاهان و سرداري (به ترتيب با كم ترين و بيش ترين وزن هزار دانه) نشان دادند كه مي تواند در نتيجه نقش تنظيم كنندگي منفي آن ها بر اندازه دانه باشد. همچنين، با افزايش كيفيت نانوايي ارقام مورد بررسي، بيان نسبي miR172a و miR159a كه به ترتيب در سنتز نشاسته و پروتئين هاي ذخيره اي دانه دخيل هستند، كاهش و بيان miR827a كه در فرايند انتقال مجدد نيتروژن از برگ به دانه دخيل است، افزايش يافت كه نشان دهنده آثار منفي miR172a و miR159a و مثبت miR827a بر كيفيت نانوايي ارقام گندم مي باشد.