تشخيص پيش از تولد بتا تالاسمي از طريق cffDNA با تكنيك NGS و آناليز RHDO

بتا تالاسمي يك گروه از اختلال هاي خوني ارثي با وراثت اتوزومي مغلوب است. موثرترين روش براي كاهش اين بيماري ارثي، تشخيص پيش از تولد است. نمونه برداري تهاجمي جهت بررسي جنين با خطر سقط تقريبي يك درصد براي جنين همراه است. DNA ي آزاد جنيني در پلاسما مادر، منبع بسيار خوبي از مواد ژنتيكي براي تشخيص هاي مولكولي پيش از تولد جنين است. (RHDO) Relative Haplotype Dosage Analysis كه بر اساس هاپلوتيپ است، به عنوان يك كاربرد در تشخيص پيش از تولد اميدبخش است. هدف از اين مطالعه، بررسي بيماري بتا تالاسمي از طريق تكنيكNextGeneration Sequencing (NGS) با آناليز (RHDO) است. در اين مطالعه 5 زوج ناقل بتا تالاسمي (مينور) با روش Amplification Refractory Mutation System Polymerase chain reaction (ARMSPCR) نسبت به موتاسيونG A IVSIII تعيين ژنوتيپ شدند. طي حاملگي 10 سي سي خون از هر خانم باردار و همچنين نمونه ي بزاق از همسرانشان گرفته شد. نمونه ها به مركز Genoma ايتاليا جهت بررسي با تكنيك NGS ارسال شد. در نهايت نتايج بدست آمده با روش تهاجمي مقايسه شد. نتايج بدست آمده از تكنيك NGS با آناليز RHDO بدون نياز به آناليز فرد مبتلا با بررسي بلوك هاي هاپلوتيپي داراي دقت و صحت 100 درصد است. نتايج حاصل از Cellfree fetal DNA (cffDNA) طبق پروتكل كشوري براي بيماري بتا تالاسمي تاييد شدند. از 5 نمونه ي جنيني بدست آمده از زوج هاي بالا كه نسبت به موتاسيون IVSII1 G A بررسي شدند، ا جنين مبتلا، 2 جنين نرمال و 2 جنين مينور بودند. حساسيت و ويژگي تست NGS 100 درصد بود و همچنين ارزش پيش بيني كننده مثبت و منفي 100 درصد بود. تعيين توالي هدفمند پلاسماي مادري براي NIPD در بتا تالاسمي با استفاده از نرم افزار SHAPEIT براي آناليز RHDO ميسر است. بنابراين مي توان با استفاده از نرم افزارهاي جديد در اين زمينه بدون نياز به اطلاعات ساير اعضاي خانواده هاپلوتيپ والدين را تهيه كرد.