شناسايي ژن هاي مرتبط با پيش‌ آگهي در سرطان پستان Her2enriched با استفاده از تجزيه و تحليل شبكه هم‌ بياني ژني

مقدمه: زيرگروه Her2enriched در سرطان پستان پيش آگهي بدتري نسبت به زيرگروه هاي لومينال دارد. و اخيرا كشف درمان هاي هدفمند در ساير گروه هاي سرطان پستان منجر به افزايش بقاء بيماران شده است. هدف اين مطالعه شناخت ژن هاي موثر در بقاي كلي اين دسته از بيماران مبتني بر زيست شناسي سامان ه اي است. روش بررسي: مجموعه داده هاي بيان ژن و اطلاعات باليني 58 بيمار مبتلا به زيرگروه Her2enriched از اطلس ژنوم سرطان دانلود شد. با استفاده از شبكه هم بيان ژني وزن دار، ماژول هاي هم بيان شناسايي شدند. به منظور شناسايي ماژول هاي موثر بر بقاي كلي، از رگرسيون كاكس استفاده شد. آناليز بقاء تك ژني در درون ماژول منتخب انجام و در پايان ژن هاي معني دار با استفاده از ابزار DAVID مورد تفسير عملكردي قرار گرفتند. يافته ها: از ميان شش ماژول هم بيان شناسايي شده، دو ماژول به طور معني دار با پيش آگهي بدتر در بيماران مرتبط بودند. بر مبناي آناليز بقاي تك ژني، 39% از ژن هاي ماژول منتخب، معنادار شناخته شد كه رابطه معناداري با مسيرهاي زيستي Ubiquitin mediated proteolysis و RNA degradation داشتند. ژن هاي CHAMP1، PPP1R26، PRRC2B، KANSL3 و ANAPC2 به ترتيب به عنوان 5 ژن مهم در كاهش بقاي كلي شناسايي شدند. همچنين اين ژن ها در مسيرهاي مرتبط با تقسيم سلولي نقش دارند كه تاييدكننده نقش آن ها در سرطان است. نتيجه گيري: رويكرد زيست شناسي سامان ه اي مي تواند نتايج مناسبي در تحليل بقاء بيماران داشته باشد. در اين مطالعه ژن هايي شناسايي شدند كه مي توانند در مطالعات آزمايشگاهي به عنوان بيوماركرهاي پيش آگهي دهنده بقاي كلي بيماران زيرگروه Her2enriched و همچنين كانديداهاي بالقوه براي درمان هدفمند اين دسته از بيماران مورد استفاده قرار گيرند.