مطالعه وجود SNPها در ژن‌هاي SUNو OVATEدخيل در شكل ميوه گوجه‌فرنگي

شكل ميوه از صفات بسيار مهم و موثر در كيفيت گوجه فرنگي (Solanum lycopersicum L.) بوده و ژن هاي SUNو OVATE از ژن هاي كليدي كنترل كننده طول ميوه مي باشند. به منظور شناسايي SNPها (Single nucleotide polymorphism) در اين ژن ها، قطعاتي از نواحي كد كننده آنها در 96 ژنوتيپ گوجه فرنگي تكثير و با آنزيم هاي محدود كننده TruI وPstI  هضم شد. هضم قطعات تكثيري اين دو ژن در ژنوتيپ ها چندشكلي توليد نكرد بنابراين چهار ژنوتيپ از جمعيت هاي مختلف انتخاب و قطعه تكثيري ژن ها در اين ژنوتيپ ها توالي يابي شد. همرديفي توالي ها براي شناسايي SNPها با استفاده از نرم افزار Clustal Omega انجام گرفت. توالي يابي قطعه تكثيري ژن SUN منجر به شناسايي يك ناحيه اينتروني به طول 369 جفت باز شد. بر اساس نتايج، در ژن SUN ده SNP شناسايي شد. از كل SNPهاي شناسايي شده در اين ژن، 80 درصد آنها از نوع همجنس و 20 درصد آنها از نوع غيرهمجنس بود. در ژن OVATE پنج SNP شناسايي شد كه 80 درصد آنها از نوع همجنس و 20 درصد آنها از نوع غيرهمجنس بود. ميانگين تعداد SNPها به ازاي هر 100 جفت باز در نواحي اگزوني و اينتروني ژن SUN به ترتيب 0.9 و 1.62 بود. در ژن OVATE به ازاي هر 100 جفت باز نيمSNP  در ناحيه اگزوني شناسايي شد. با توجه به نقش مهم كيفيت ميوه بخصوص شكل آن در بازارپسندي گوجه فرنگي، SNPهاي شناسايي شده در اين تحقيق مي تواند در برنامه هاي اصلاحي گوجه فرنگي براي مطالعه تنوع ژنتيكي، تهيه نقشه هاي ژنتيكي و شناسايي نشانگرهاي عملكردي مرتبط با شكل ميوه مورد استفاده قرار گيرد.