توالي‌يابي نسل جديد و كاربرد آن در مطالعه ميكروبيوم در خاك‌هاي مهاركننده بيماري‌هاي گياهي

پيشرفت در تعيين توالي‌ نسل جديد نقش به‌سزايي در مطالعات مربوط به اكولوژي جمعيت‌هاي ميكروبي داشته است. اين پيشرفت‌ها منجر به توسعه سريع در تحقيقات متاژنوميكس (تحليل دي.ان.اي جمعيت‌هاي ميكروبي بدون نياز به كشت) شده است. بسياري از ابزارهاي آماري و محاسباتي و پايگاه‌هاي اطلاعاتي متاژنوميكس منجر به كشف حجم عظيمي از داده‌ها شده است. در اين تحقيق علاوه‌بر مرور روش تعيين توالي نسل جديد، ابزارها و روش‌هاي بيوانفورماتيك مورد استفاده، موارد مطالعه شده درباره ميكروبيوم خاك‌هاي بازدارنده و دست ورزي ميكروبيوم جهت مقابله با بيماري‌هاي گياهي ارائه و مورد بحث قرار مي‌گيرند. خاك بازدارنده به خاكي گفته مي‌شود كه در آنها با وجود حضور عوامل بيمارگر شناخته‌شده، شيوع بيماري‌هاي گياهي بسيار كمتر است. توجه به ساختار و شناسايي دقيق ميكروبيوم اين خاك‌ها بسيار مورد علاقه طرفداران كاهش مصرف سموم شيميايي است.