بررسي تنوع ژنتيكي ماهي ساردين رنگين كمان (Dussumieria acuta) در خليج فارس و درياي عمان(محدوده استان استان هرمزگان) با استفاده از ژن COI

Study of genetic diversity of Dussumieria acuta (Valenciennes, 1847) in Persian Gulf and Oman sea (Coast of the Hormozgan Province) using Cytochrome oxidase subunit I gene (COI)

در اين بررسي 12 نمونه ماهي ساردين رنگين كمان از 6 منطقه جاسك، قشم و بندر لنگه صيد گرديد. استخراج DNA با روش فنل-كلروفرم از بافت باله ماهيان انجام شد. به منظور ارزيابي تنوع ژنتيكي ساردين رنگين كمان از ژن COI استفاده شد. تكثير ژنCOI با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي طراحي شده بر اساس توالي هاي موجود در بانك ژن صورت گرفت. طول 619 جفت باز از محصول واكنش زنجيره پلي مرازي توالي يابي شد. توالي هاي ژني نمونه ها با استفاده از نرم افزارهاي MEGA5 و Bioedit7 مورد مقايسه قرار گرفتند و ميزان همولوژي نمونه ها مشخص گرديد. همچنين با استفاده از نرم افزار dnaSP5 ميزان پلي مورفيسم يا تعداد هاپلوتيپ ها ارزيابي شد. نتايج اين تحقيق نشان داد كه در بين نمونه هاي جمعيت هاي مختلف ساردين رنگين كمان فاصله ژنتيكي كمي وجود دارد. همچنين تعداد 9 نوع هاپلوتيپ بين نمونه هاي مورد مطالعه شناسايي گرديد.

In this study 12 specimens were collected from Bandar Jask, Qeshm Island and Bandare Lengeh in Hormozgan Province. DNA extraction was performed using Phenol-Chloroform method. A partial DNA sequence of Cytochrome oxidase subunit I gene (COI) was used to evaluate genetic diversity. The sequence of Cytochrome oxidase subunit I gene was done using specific primers designed based on sequences registered in NCBI GenBank. The diversity of 619 bp of COI was estimated. Gene sequencing of samples were compared with using MEGA5 and Bioedit7 software. Also, polymorphism or haplotype frequency was evaluated using dnaSp7 software. Results showed that there was low genetic distance equals to among all population and 9 haplotypes among samples were determined.