شناسايي و مقايسه ايزوفرم هاي ميكرو‌آر.ان.اي Let-7 در ماهي آزاد ماهيان با استفاده از داده هاي بيوانفورماتيك

ميكروآر.ان.اي توالي‌هاي كوتاه غير كدشونده‌اي هستند كه تنظيم بيان ژنها را در مرحله بعد از رونويسي انجام مي‌دهند، اين نوع از آر.ان.اي غير‌كد‌شونده در تنظيم بيان 60 درصد از ژنها دخالت دارند. در آزاد ماهيان تعداد بسيار محدودي از ميكرو آر.ان.اي ها شناسايي شده است. لذا در اين تحقيق به منظور شناسايي ايزوفرم‌هاي مختلف ميكروآر.ان.اي Let-7 در آزاد ماهيان، داده هاي بيوانفورماتيك موجود در NCBI مورد استفاده قرار گرفت. 43 ميليون خوانش با طول حدود 22 باز مورد بازبيني قرار گرفت كه از اين مقدار 17/8 ميليون با Let-7 همخواني داشتند، 9 ايزوفرم مختلف از خانواده Let-7 شناسايي شد كه 8 عدد از آنها با ايزوفرم هاي شناسايي شده در ساير رده هاي جانوري تطبق داشته است و يك ايزوفرم جديد كه داراي يك باز اختلاف با ايزوفرم Let-7f در آزاد ماهي اقيانوس اطلس (Salmo salar) است نيز شناسايي شد. ايزوفرم Let-7a نيز در ميان 9 ايزوفرم داراي بيشترين فراواني بوده است. براي 9 ايزوفرم شناسايي شده تعداد 20 لوكوس بر روي كروموزوم‌هاي ژنوم مرجع (Otsh.V1) در مركز داده هاي NCBI شناسايي شد و بدين طريق مشخص گرديد كه تعداد 7 لوكوس بر روي ژنوم به صورت خوشه هاي ژني از Let-7 مي‌ باشند، 2 لوكوس ديگر نيز براي ايزوفرم Let-7c بر روي قطعاتي از ژنوم مرجع كه در كروموزوم ها مكان‌يابي نشده بودند شناسايي شد.