رديابي جايگاه‌هاي كنترل كننده صفات كمي براي پارامترهاي منحني رشد در گوسفند نژاد قزل

Mapping of Quantitative Trait Loci for parameters of growth curve regression in Ghezel sheep

سابقه و هدف: يكي از معايب برآورد پارامترهاي ژنتيكي بر اساس وزن مطلق گوسفند در يك سن خاص اين است كه برخي از ژن‌ها فقط در يك دورة خاص از زندگي حيوان بر رشد مؤثر هستند. اثرات پليوتروپي نيز بين صفات مقطعي وزن در سنين مختلف وجود دارد. به طوري كه انتخاب براي يك صفت، سبب پاسخ همبسته در ساير صفات مي‌شود. پس تمركز بر تمام مراحل منحني رشد و مولفه‌هاي توصيف كننده‌ي اين منحني مي‌تواند پيشرفت ژنتيكي بيشتري را حاصل آورد. نتايج تحقيقات نشان مي‌دهد كه پارامترهاي منحني رشد در گونه‌هاي مختلف وراثت پذير هستند. بنابراين امكان تغيير شكل منحني رشد از طريق انتخاب وجود دارد. شناخت روابط ژنتيكي و محيطي بين وزن‌هاي مختلف، بلوغ و نرخ رشد در تمام مراحل رشد براي طراحي برنامه اصلاح نژادي به منظور بهبود كارايي توليد در طول عمر حيوان ضروري است. لذا شناسايي و مكان يابي جايگاههاي كنترل كننده‌ي صفات كمي براي پارامترهاي منحني رشد به عنوان صفات وراثت‌پذير مي‌تواند سناريوي تحقيقاتي مفيدي براي بررسي باشد كه در نهايت سبب افزايش توليد گوشت شود. مواد و روش‌ها: پارامترهاي منحني رشد با استفاده از مدل برودي و اطلاعات 27537 رأس گوسفند قزل تخمين‌زده شد. شجره‌ي جمعيت مورد مطالعه توسط نرم افزارهاي شجره پرداز مورد بررسي قرار گرفت. دو خانواده كه داراي شرايط طرح خواهر برادر ناتني بودند انتخاب شدند. سپس براي انجام اين پژوهش، از 51 نتاج دو خانواده‌ي ناتني گوسفندان قزل (گوسفندان مربوط به ايستگاه تحقيقاتي پرورش و اصلاح نژاد گوسفند قزل مياندوآب بودند( خونگيري به عمل آمد. براي تعيين ژنوتيپ ازهشت نشانگر ريزماهواره كه روي كروموزوم‌هاي دو و پنج مستقر بودند استفاده شد. فاصله‌ي نشانگرها از يكديگر روي نقشه‌ي كروموزومي كمتر از30 سانتي مورگان بود. استخراج دي ان ا با استفاده از روش‌كلروفورم و ايزوآميل الكل از خون كامل صورت گرفت. جهت تكثير جايگاه‌هاي ريز ماهواره از برنامه‌ي Touchdown PCR و ژل متافور آگارز 4 درصد استفاده شد. از نرم افزار UVDOC براي امتيازدهي باندها استفاده شد. آمار توصيفي براي شاخص‌هاي مولكولي هر جايگاه ريزماهواره‌ايي با استفاده از نرم افزار PopGene محاسبه شد. پس از اتمام تعيين ژنوتيپ، سه فايل نقشه‌ي كرومووزومي، ركوردهاي ژنوتيپي و فنوتيپي تهيه شد. سپس بررسي نرماليته داده‌هاي خام و تصحيح براي اثرات ثابت )جنسيت، تيپ تولد،… (، توسط رويه GLM نرم افزارSAS نسخه 9.2 ساخت سال 2015، انجام شد. روش مورد استفاده براي تجزيه و تحليل مكان يابي جايگاه‌هاي كنترل كنندهي صفات كمي شناسايي ارتباط مابين نشانگرهاي ژنتيكي و جايگاه‌هاي كنترل كنندهي صفات كمي توسط دو نشانگر بود. يافته‌ها: نتايج تجزيه و تحليل ريزماهواره‌ها نشان داد كه چندشكلي مناسبي در جمعيت مورد مطالعه وجود دارد. در نهايت نتايج حاصل از دو خانواده مورد نظر نشانگر عدم شناسايي جايگاه‌هاي كنترل كنندهي صفات كمي معني دار روي كروموزوم‌هاي شماره دو و پنج براي صفات پارامترهاي منحني رشد برودي (A,B,C) بود. نتيجه‌گيري: طي تجزيه و تحليل هاي انجام شده جايگاه‌هاي كنترل كننده ي صفات كمي معني‌داري يافت نشد. البته طرح مربوطه به دليل كم بودن تعداد نشانگرها، تعداد خانواده و اعضاي هرخانواده نقايضي را متحمل شد. اين عوامل در جاي خود مي‌توانند دليلي بر عدم شناسايي جايگاه‌هاي كنترل كنندهي صفات كمي در اين طرح باشد.

Background and purpose: One of the disadvantages of estimating genetic parameters based on the absolute weight of sheep at a given age is that some genes affect growth only in a specific period of animal life. There are also pleiotropic effects between weight cross-sectional traits of different ages. Therefore, that selection for one trait causes a correlated response in other traits. So focusing on all the stages of the growth curve and the components that characterize the curve can produce more genetic progress. Research results show that growth curve variables are heritable in different species. Therefore, it is possible to modify the growth curve through selection. Understanding the genetic and environmental relationships between different weights, maturity and growth rates at all stages of development is essential for designing a breeding program to improve production efficiency over the lifetime of the animal. Therefore, identifying and locating QTLs controlling growth curve parameters as heritable traits could be a useful research scenario for investigation. Ultimately, it will increase meat production. Materials and Methods: Growth curve parameters were estimated using the Brody model and data of 27537 Ghezel sheep. These population pedigree checked by software pedigree viewer and the two families were selected for this project To do present research two half-sib family, 51 offspring of two genera of sheep breeding in the Ghezel Miandoab Breeding station of were taken. The chromosomal positions were located on 2 and 5 of the microsatellite were used to determine the genotype. The marker spacing on the chromosomal map was under 30CM. The DNA extraction was performed using Sammady Shams and colleagues from the whole blood and 4% metaphor agarose gel was used for multiplication of microsatellite sites using Touchdown PCR and. UVDOC software was used to score bands. Descriptive statistics were calculated for molecular indices of each markers locus using POPGENE software. Upon completion of genotyping three files map, genotype and records phenotype were prepared and then evaluated normality raw data and correction for fixed effects (gender, type of birth,) by the procedure GLM in SAS 9.2 software made in 2015 was carried out. The analysis results microsatellites showed that polymorphism fit there, but alleles heterozygous rams similarity high, suggesting consanguinity with alleles of the sheep show. The method used to The QTL analysis was identified the relationship between genetic markers and QTLs by two markers. Results: The results of microsatellite analysis showed that there is a good polymorphism in the studied population. Finally, the results of the two families indicated no significant QTL identification on chromosomes 2 and 5 for traits of brody growth curves parameters (A, B, C). Conclusions: No significant differences were found in the QTL analysis. Of course, the plan was criticized because of the low number of markers, the number of families and each family member. These factors may, in turn, be the reason for the lack of QTL identification in this design.