شناسايي، كلونينگ و توالي‌يابي ژن پيسيدين ماهي شانك سر طلايي (Sparus aurata) در باكتري Escherichia coli

پيسيدين در از بين بردن ميكروارگانيسم ها اعم از باكتري، قارچ، ويروس، انگل طيف گسترده اي دارد و داراي فعاليت قوي ضدتوموري است و در افزايش ايمني ذاتي نقش دارد و لذا در برابر باكتري ها مقاومت ايجاد نمي كند؛ بنابراين از اهميت بالايي در آبزي پروري برخوردار است. در اين پژوهش كلونينگ ژن پيسيدين ماهي شانك سر طلايي (Sparusaurata) در وكتور pTZ57R/T صورت گرفت. محصول اتصال به سلول هاي مستعد باكتري E. coli سويه DH5 α منتقل شدند. از تك كلني هاي مشاهده شده در پليت آمپي سيلين، استخراج پلاسميد انجام گرفت. تاءييد صحت تك كلني هاي رشد يافته در اين پژوهش، با روش هاي PCR مستقيم و تعيين توالي انجام گرديد. قطعه تكثير شده cDNA ژن پيسيدين ماهي شانك سرطلايي متشكل از 310 نوكلئوتيد و 57 آمينواسيد است. نتايج حاصل از اين پژوهش نشان داد كه ژن پيسيدين در وكتور pTZ57R/T با موفقيت كلون گرديده است. مقايسه توالي نوكلئوتيدي ژن پيسيدين در اين پژوهش شباهت بالايي را با پيسيدين 5 گونه Morone chrysops نشان داد. مقايسه توالي آمينواسيدي سيگنال پپتيد پيسيدين كاملا مشابه با Dicentracin-like همين گونه ثبت شده در بانك ژني بوده و توالي پپتيد بالغ پيسيدين تنها در سه آمينواسيد با Pleorocidinlike گونه Poesila farmosa و Dicentracin-like گونه Sphaeramia orbicularis شباهت دارد. اين پژوهش مي تواند گامي براي مطالعات بعدي پپتيد پيسيدين باشد.