عنوان مقاله :
تعيين هويت مولكولي و آناليز فيلوژنتيكي ويروس طاعون نشخواركنندگان كوچك در سالهاي 95 و 97 در استان قم
عنوان به زبان ديگر :
Molecular detection and phylogenetic analysis of Peste des petits ruminant’s virus in QOM Province 2016 and 2018
پديد آورندگان :
بازيار، حسن دانشگاه شهيد چمران اهواز - دانشكده دامپزشكي، اهواز، ايران , نوري، محمد دانشگاه شهيد چمران اهواز - دانشكده دامپزشكي -گروه علوم درمانگاهي، اهواز، ايران , قدردان مشهدي، عليرضا دانشگاه شهيد چمران اهواز - دانشكده دامپزشكي -گروه علوم درمانگاهي، اهواز، ايران , صيفي آباد شاپوري، مسعود رضا دانشگاه شهيد چمران اهواز - دانشكده دامپزشكي -گروه پاتوبيولوژي، اهواز، ايران , ورشوي، حميدرضا سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - مؤسسه تحقيقات و سرم و واكسن‌سازي رازي، كرج، ايران , داندون، ويليام جي سازمان خواربار و كشاورزي در مواد غذايي و كشاورزي - آزمايشگاه سايبرزردورف - بخش فن‌آوري‌هاي هسته‌اي، وين، اتريش , هدايتي، زينب سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - مؤسسه تحقيقات و سرم و واكسن‌سازي رازي، كرج، ايران
كليدواژه :
طاعون نشخواركنندگان كوچك , پاراميكسو‌ويروس , هويت مولكولي , دودمان
چكيده فارسي :
طاعون نشخواركنندگان كوچك (PPR) بيماري ويروسي بسيار واگير، شديد و كشنده نشخواركنندگان كوچك است. چهار دودمان (Lineage) ويروس PPR بر اساس تحليل توالي ژن نوكلئوپروتئين (N) و فيوژن (F) شناخته شده است. هدف از اين مطالعه، بررسي تعيين هويت مولكولي و آناليز فيلوژنتيكي ويروس طاعون نشخواركنندگان كوچك در رخدادهاي PPR سالهاي 95 و 97 در استان قم بوده است. 10 نمونه ي بافتي (غدد لنفاوي مزانتر) پس از كالبدگشايي از حيوانات مشكوك باليني جمعآوري شد و وجود ويروس PPR با روش RT-PCR يك مرحلهاي مورد بررسي قرار گرفت. بررسي توالي قطعهاي از ژن نوكلئوپروتئين (N) و آناليز فيلوژنتيكي نمونههايي كه در RT-PCR مثبت بودند جهت تعيين دودمان جدايهها انجام گرفت. از 10 نمونه باليني مورد بررسي، 40 درصد آنها بر اساس بررسي اسيد نوكلئيك ويروس با روش RT-PCR مثبت بودند. آناليز توالي نوكلئوتيدي و تجزيه فيلوژنتيكي جدايه ها نشان داد كه جدايههاي به دست آمده در رده ي آسيايي (دودمان IV) ويروس PPR قرار دارد. نتايج فيلوژنتيك اين مطالعه، حضور ويروس PPR دودمان IV را در ميان دامهاي مبتلا به طاعون نشخواركنندگان كوچك استان قم، تأييد مي‌كند. بنابراين اين مطالعه نشان ميدهد كه جدايههاي PPRV ايران به دودمان چهارم مربوط ميشوند و با جدايه هاي PRPV پاكستان، تاجيكستان و هند ارتباط نزديك دارند. توصيه ميشود به منظور ترسيم دقيقتري از وضعيت حضور و چرخش دودمان يا دودمان‌هاي ويروس PPR در ايران، مطالعات بيشتري از ديگر مناطق كشور به خصوص نواحي مرزي انجام گيرد.
چكيده لاتين :
Background: Peste des Petits Ruminants (PPR) is a severe, highly infectious and fatal viral disease of small ruminants. Four lineages of PPR virus have been identified globally based on sequence analysis nucleoprotein (N) and fusion (F) gene. The aim of this study was molecular detection and phylogenetic analysis recently circulating PPR virus in small ruminants in QOM Province in Iran. A total of 10 anti-mortem samples (mesenteric lymph node) were collected from clinically suspicious animals and examined for the presence of PPRV by a one-step RT-PCR assay. Samples positive with RT-PCR were subjected to subsequently genetically characterized by sequencing of the nucleoprotein (N) gene and phylogenetic analysis of PPR virus (PPRV) strains.
Results: Of the 10 clinical samples examined, 40.0% were positive with RT PCR for viral nucleic acid. The nucleotide sequence and phylogenetic analysis indicated that these isolates were clustered genetically with Lineage IV isolates of the PPRV.
Conclusion and discussion: phylogenetic analysis and molecular findings of this study confirmed active lineage IV PPRV infections among goat populations in QOM Province.This study and latter studies revealed that the Iranian PPRV isolates belong to lineage IV and are closely related to the Pakistan, Tajikistan and India isolates of PRPV. We recommended that more studies should be done from other parts of the country, especially the border areas, in order to more accurately illustrate the status and circulation of the active lineage of the PPR virus in Iran.
عنوان نشريه :
دامپزشكي ايران
