پديد آورندگان :
برادر، علي دانشگاه وليعصر - دانشكده كشاورزي - گروه گياهپزشكي , حسيني، احمد دانشگاه وليعصر - دانشكده كشاورزي - گروه گياهپزشكي , عبداني بابكي، سميه دانشگاه وليعصر - دانشكده كشاورزي - گروه گياهپزشكي , حسيني فرهنگي، ثمين السادات دانشگاه وليعصر - دانشكده كشاورزي - گروه گياهپزشكي
كليدواژه :
بيماري‌هاي ويروسي , پي‌سي‌آر , تبارزايي , موتيف , نوتركيبي
چكيده فارسي :
ويروس موزائيك زرد لوبيا (Bean yellow mosaic virus) يكي از ويروس‌هاي متعلق به جنس پوتي‌ويروس، داراي دامنه ميزباني وسيع و پراكندگي جغرافيايي گسترده‌اي مي‌باشد. اين ويروس ساليانه خسارت بالايي به حبوبات مختلف از جمله باقلا در ايران وارد مي‌كند. در اين پژوهش13 جدايه ويروس موزائيك زرد لوبيا از مزارع باقلاي استان‌هاي مختلف ايران (استان‌هاي سيستان و بلوچستان، هرمزگان، كرمان، خوزستان، فارس، لرستان، ايلام، همدان، قزوين، زنجان، اردبيل و آذربايجان‌شرقي) جمع‌آوري گرديد. ناحيه پروتئين پوششي جدايه‌هاي جمع‌آوري شده پس از توالي‌يابي با توالي پروتئين پوششي 178جدايه منتخب از GenBank، مورد مقايسه قرار گرفت. توالي‌هاي نوكلئوتيدي جدايه‌هاي ايراني مورد بررسي، به ميزان 99-86 درصد با ساير توالي‌هايBYMV مشابهت داشتند. روابط تبارزايي جدايه‌هاي ويروس موزائيك زرد لوبيا پس از حذف جدايه‌هاي نوتركيب، با رسم درخت به روش Maximum Likelihood و بر اساس توالي نوكلئوتيدي ناحيه پروتئين پوششي مورد بررسي قرار گرفت. بر اين اساس همه جدايه‌ها به جز سه جدايه AI38، PAC-1، BYMV-W در هشت گروه مونوفيلتيك قرار گرفتند. جدايه‌هاي ايراني در دو گروه متمايز در كنار جدايه‌هاي باقلا، عدس، لوبيا، گلايول و آفتابگردان از كشورهاي ژاپن، استراليا، عراق و اسپانيا تقسيم‌بندي شدند. براساس نتايج بدست آمده، رابطه مستقيمي بين گروه‌بندي جدايه‌ها براساس بررسي تبارزايي توالي نوكلئوتيدي ناحيه پروتئين پوششي و منشا ميزباني و جغرافيايي مشاهده نشد. بررسي ساختار پروتئين پوششي در جدايه‌هاي ايراني و ساير جدايه‌هاي موجود در GenBank نشان‌دهنده حفاظت‌شدگي بالاي نواحي انتهايي كربوكسيل و ناحيه مركزي پروتئين پوششي و متغير بودن ناحيه ابتداي آميني بود.
كليدواژه‌ها
چكيده لاتين :
Bean yellow mosaic virus, a species of the genus Potivirus, has a wide host range and a broad geographical distribution. BYMV causes high annual economic damage in various legumes such as faba beans in Iran. In this study, 13 BYMV isolates were collected from faba bean fields of different provinces of Iran (Sistan and Baluchestan, Hormozgan, Kerman, Khuzestan, Fars, Lorestan, Ilam, Hamadan, Ghazvin, Zanjan, Ardabil, East Azerbaijan). The coat protein (CP) region of the collected isolates was sequenced and then compared with the CP sequence of 178 isolates available in GenBank. The selected Iranian sequences showed 86-99% nucleotide sequence identities with other BYMV isolates. Phylogenetic relationships based on CP nucleotide sequences were estimated using the Maximum Likelihood method, after removing all recombinant sequences. Accordingly, all isolates excluding three isolates, AI38, PAC-1, BYMV-W were placed in eight monophyletic groups. Iranian isolates were located in two distinct groups, along with broadbean, lentil, bean, gladiolus and sunflower isolates from Japan, Australia, Iraq and Spain. According to the results there is no significant relation among clustering of BYMV isolates based on phylogenetic analysis of CP sequences and original host and country. The CP structure analysis of Iranian isolates and other selected isolates from GenBank revealed conservation of the C-terminus and the central region of the coat protein and the variation of the N-terminus.
