تخمين واريانس غلبه و اثر آن روي تخمين پارامترهاي ژنتيكي صفات كيفي لاشه

Estimation of dominance variance and its effects on the evaluation of the genetic parameters for carcass quality traits

به‌منظور تعيين تداخل اثرات غلبه در برآورد پارامترهاي ژنتيكي، از دو مدل افزايشي و افزايشي - غلبه براي برآو رد پارامترهاي ژنتيكي صفات مختلف كيفيت 631 لاشه گاو گوشتي نر دورگ استفاده ‌شد. داده ها با استفاده از نرم‌افزار‌هاي Plink (نسخه 1/9) و GVCBLUP (نسخه 3/9) تجزيه شدند. نتايج نشان‌ داد كه بيشتر صفات كيفي لاشه وراثت‌پذيري بالايي داشتند، اما دو صفت ماهيچه چشمي دنده اولتراسوند و وزن لاشه گرم داراي وراثت‌پذيري پاييني (به‌ترتيب 0/15 و 0/11) بودند. واريانس غلبه براي صفات وزن لاشه گرم، ماهيچه چشمي دنده اولتراسوند، چربي پشت اولتراسوند و ماهيچه چشمي دنده (به‌ترتيب 0/13، 0/440، 0/89 و0/33) بالا بود ولي براي ساير صفات (توليد گوشت لخم، درجه ماربلينگ، چربي پشت، ماهيچه چشمي دنده اولتراسوند و درجه لاشه) اثر غلبه مشاهده نشد يا بسيار جزئي برآورد گرديد. هنگامي كه واريانس غلبه صفات پايين بود، تاثيري بر برآورد GBLUP نداشت. برآورد وراثت‌پذيري صفات مورد بررسي به مقدار كم تحت‌تاثير افزودن اثر غلبه در مدل قرار گرفت. مهم‌ترين نواحي ژنومي موثر بر صفات كيفي لاشه مربوط يه ژن-هاي LAP3، THBS4 و PCDH9 بود. پيشنهاد مي گردد، براي درك بهتر از ساختار ژنتيكي صفات و برنامه ريزي بهتر اصلاح نژادي، اثرات غلبه در مدل برآورد پارامترهاي ژنتيكي اضافه شود. كليدواژه‌ها

In order to determine the interference of dominant effects on the estimation of genetic parameters, two models including additive and additive-dominance were used for estimation of genetic parameters of carcass traits in 631 hybrid beef bulls. Data analysis was conducted using Plink (V. 1.9) and GVCBLUP (V. 3.9) softwares. Results of this study showed that most carcass quality traits have high heritability, but two traits namely hot carcass weight and ultrasound ribeye area had low heritability (0.15 and 0.11). Dominance variances have high contribution to the total variation of hot carcass weight, ultrasound ribeye area, ultrasound backfat thickness and ribeye area (0.13, 0.44, 0.89 and 0.33 respectively). However, dominant effect for other traits (lean meat yield, marbling score, backfat thickness, ultrasound ribeye area and grade of carcass) was not observed or was in very low amount. When dominance variance is low, its effect on GBLUP estimates is negligible. The estimates of heritability did not change significantly by the adding dominance effect into the model. The most important genomic regions that affect the carcass quality traits were belong to LAP3, THBS4 and PCDH9 genes. It is suggested that for the better understanding of the genetic structure of traits and better breeding plan, the dominance effects should be added into the model for genetic parameter estimation.