جداسازي و شناسايي گونه ‌هاي نوكارديا از نمونه هاي شست وشوي برونش و خلط بيماران مشكوك به نوكارديازيس با استفاده از روش مولكولي مبتني بر توالي PCR در استان خوزستان

Isolation and identification of Nocardia species from bronchial lavage and sputum specimens of patients suspected of Nocardiasis using molecular method based on PCR sequence in Khuzestan province

سابقه‌ و هدف: نوكارديا عضوي از خانواده نوكاردياسه است كه54 گونه براي انسان بيماري­زا هستند. با توجه­ به اينكه مطالعه­ هاي كمي در خصوص شيوع نوكاريازيس در استان خوزستان انجام گرفته است هدف از انجام اين مطالعه جداسازي و شناسايي گونه­‌هاي نوكارديا از نمونه­ هاي شست­ وشوي برونش و خلط بيماران مشكوك به نوكارديازيس با استفاده از روش مولكولي PCR در استان خوزستان است. مواد و روش‌ها: در اين بررسـي تعـداد 178 نمونه شست ­وشوي برونش و 100 نمونه خلط از بيماران مشكوك به نوكارديازيس در طي مدت 1سال جمع ­آوري گرديده و به آزمايشگاه ميكروب ­شناسي شهر اهواز جهت شناسايي دقيق فرستاده شدند سپس از شناسايي از طريق PCR رديابي ژن­هاي 16 S rRNA، NG و Betانجام گرفت و محصولات PCR تعيين توالي گرديد. يافته‌ها: در اين مطالعه 278 نمونه شامل 178 نمونه شست ­وشوي برونش و 100 نمونه خلط اخذ شده از بيماران مشكوك به نوكارديوزيس مورد بررسي قرار گرفتند.. نتايج تعيين توالي نـشان داد كه 27 مورد از نمونه ­ها از نظر گونه­ هاي نوكارديا مثبت بود .از 7 نمونه شست ­و شوي برونش، 6 مورد متعلـق­بـه گونـهN . Nova و 1 مورد متعلق­به گونه farcinica..N است. 20 نمونه مربوط به خلط و8 متعلق­به N. cyriacigeorgica 4نمونه مربوط به farcinica..N 3 نمونه مربوط­به N. asteroides و5 نمونه مربوط­به N. nova بود. نتيجه‌گيري: مطالعه حاضر نشان از تواناي بالاي روش مولكولي در تشخيص دقيق جنس و گونه نوكارديا دارد و لزوم مطالعه بيش­تر اين بيماري در مطالعه­ هاي آينده بيش از پيش احساس مي­ شود. نوكارديوزيس نبايد به ­عنوان يك بيماري غيرمعمول تلقي شود هم­چنين در مطالعه ما نشان داده شد كه شاخص بالايي از از نظر شيوع باليني به ­خصوص در بيماران نقص ايمني و بيماران ريوي و مبتلا به سل دارد.

Aim and Background: Nocardia is a member of the Nocardiaceae family. Due to the fact that few studies have been conducted on the prevalence of nocariasis in Khuzestan province, the aim of this study was to isolate and identify nocardia species from bronchial lavage and sputum specimens of patients suspected of nocardiasis using molecular PCR in Khuzestan province. Materials and Methods: In this study, 178 bronchial lavage samples and 100 sputum samples were collected from patients suspected of nocardiasis during 1 year and sent to Ahvaz Microbiology Laboratory for more accurate identification, then identified by PCR for gene tracking. 16 S rRNA, NG and Bet were performed and PCR products were sequenced. Results: In this study, 278 samples including 178 samples of bronchial lavage and 100 samples of sputum taken from patients suspected of neocardiosis were examined. Sequencing results showed that 27 of the samples were positive for Nocardia species. Out of 7 bronchial lavage samples, 6 belonged to N type. Nova and 1 case belong to .N .farcinica. 20 samples belonged to sputum and 8 belonged to N. cyriacigeorgica, 4 samples belonged N .farcinica 3 samples belonged to N. asteroides and 5 samples belonged to N. nova. Conclusion: The present study shows the high ability of molecular methods in accurate diagnosis of species and species of Nocardia and the need for further study of this disease in future studies is felt more than ever.